More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0787 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  100 
 
 
291 aa  596  1e-169  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  36.36 
 
 
278 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  32.86 
 
 
273 aa  122  1e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  32.38 
 
 
273 aa  119  4e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  32.51 
 
 
283 aa  119  8e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  34.22 
 
 
264 aa  115  1e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  36.4 
 
 
273 aa  111  2e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0016  hypothetical protein  32.03 
 
 
290 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3809  Rhomboid family protein  28.43 
 
 
304 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  32.91 
 
 
276 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6620  Rhomboid family protein  29.52 
 
 
292 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000794004  hitchhiker  0.00987109 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  38.79 
 
 
224 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  32.49 
 
 
232 aa  99.4  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5567  Rhomboid family protein  30.23 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0483  Rhomboid family protein  28.77 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  34.52 
 
 
220 aa  94.4  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  35.32 
 
 
220 aa  93.6  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0277  Rhomboid family protein  34.14 
 
 
293 aa  93.2  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499185  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2146  Rhomboid family protein  28.68 
 
 
258 aa  92.4  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  9.5331e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  32.23 
 
 
258 aa  92.4  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  32.16 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  29.43 
 
 
296 aa  89.7  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0209  rhomboid family protein  28.15 
 
 
287 aa  89.4  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  33.13 
 
 
226 aa  89  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  34.76 
 
 
200 aa  88.6  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  34.62 
 
 
211 aa  88.2  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  35.64 
 
 
246 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  34.5 
 
 
218 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  33.95 
 
 
279 aa  89  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  32.09 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  32.56 
 
 
226 aa  87.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  31.14 
 
 
234 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07080  putative transmembrane rhomboid family protein  29.66 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  35.98 
 
 
197 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  38.15 
 
 
227 aa  87.4  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  34.55 
 
 
198 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  30 
 
 
260 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  30 
 
 
260 aa  85.1  1e-15  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  36.63 
 
 
249 aa  84  3e-15  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  30 
 
 
229 aa  83.6  3e-15  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  29.67 
 
 
444 aa  83.6  3e-15  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  36.36 
 
 
207 aa  83.6  4e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  31.44 
 
 
238 aa  83.6  4e-15  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1696  rhomboid-like protein  29.55 
 
 
256 aa  83.2  4e-15  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0169703  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  51.61 
 
 
230 aa  83.2  5e-15  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  38 
 
 
216 aa  83.2  5e-15  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  32.52 
 
 
228 aa  82.8  6e-15  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  27.94 
 
 
247 aa  82.4  8e-15  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  35.36 
 
 
231 aa  82.4  9e-15  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  33.33 
 
 
284 aa  82.4  9e-15  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  35.37 
 
 
265 aa  81.6  1e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  38.15 
 
 
237 aa  81.6  1e-14  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  38.92 
 
 
211 aa  82  1e-14  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  36.17 
 
 
271 aa  81.6  2e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  36.21 
 
 
241 aa  80.9  2e-14  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  32.43 
 
 
231 aa  80.9  2e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  37.36 
 
 
223 aa  80.5  3e-14  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2191  Rhomboid family protein  26.82 
 
 
262 aa  80.5  3e-14  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  32.8 
 
 
261 aa  80.1  4e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  39.16 
 
 
231 aa  79.7  5e-14  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  33.66 
 
 
202 aa  79.7  5e-14  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  33.66 
 
 
202 aa  79.7  5e-14  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  33.66 
 
 
202 aa  79.7  5e-14  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  33.66 
 
 
202 aa  79.7  5e-14  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  34.57 
 
 
220 aa  79.7  5e-14  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  36.48 
 
 
232 aa  79.7  5e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  30.25 
 
 
396 aa  79.3  6e-14  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  35.19 
 
 
225 aa  79.3  6e-14  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  38.61 
 
 
246 aa  79.3  6e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  45.1 
 
 
236 aa  79  9e-14  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1263  Rhomboid family protein  35.05 
 
 
245 aa  78.6  1e-13  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  43.43 
 
 
237 aa  78.2  1e-13  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  30.57 
 
 
229 aa  78.2  1e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  33.33 
 
 
231 aa  78.2  1e-13  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  29.25 
 
 
248 aa  78.2  2e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0686  rhomboid family protein  43.12 
 
 
231 aa  78.2  2e-13  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0078809 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  34.01 
 
 
209 aa  77.4  2e-13  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  31.76 
 
 
237 aa  77.8  2e-13  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  34.78 
 
 
248 aa  77  3e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4502  rhomboid family protein  30.11 
 
 
212 aa  76.6  4e-13  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7801  hypothetical protein  30.92 
 
 
245 aa  77  4e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.990932  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  39.6 
 
 
252 aa  77  4e-13  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  32.64 
 
 
252 aa  76.3  5e-13  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2900  rhomboid family protein  43.69 
 
 
215 aa  76.6  5e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.28632  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  32.04 
 
 
197 aa  76.3  5e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2204  rhomboid-like protein  44.9 
 
 
251 aa  76.6  5e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  33.33 
 
 
227 aa  76.3  5e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0210  rhomboid family protein  27.54 
 
 
249 aa  76.3  6e-13  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1225  regulatory proteins, IclR  30.74 
 
 
249 aa  75.9  7e-13  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0542278  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  44.9 
 
 
221 aa  75.9  7e-13  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  30.29 
 
 
196 aa  75.9  7e-13  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1727  rhomboid family protein  40.21 
 
 
324 aa  75.9  8e-13  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  42.31 
 
 
239 aa  75.5  9e-13  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0953  Rhomboid family protein  32.75 
 
 
218 aa  75.9  9e-13  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00030487  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  26.21 
 
 
486 aa  75.1  1e-12  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  34.21 
 
 
205 aa  75.5  1e-12  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  31.89 
 
 
260 aa  75.5  1e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  37.74 
 
 
222 aa  75.5  1e-12  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  30.48 
 
 
348 aa  74.7  2e-12  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  30.77 
 
 
238 aa  74.3  2e-12  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>