More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0492 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  100 
 
 
321 aa  664    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  61.01 
 
 
321 aa  414  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  53.38 
 
 
333 aa  359  4e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  47.57 
 
 
324 aa  310  2e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  45.91 
 
 
319 aa  302  4.0000000000000003e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  42.81 
 
 
320 aa  280  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  44.98 
 
 
330 aa  261  1e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  43.08 
 
 
333 aa  259  4e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  41.4 
 
 
327 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  41.53 
 
 
320 aa  246  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  40.31 
 
 
329 aa  245  9e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  42.49 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  41.19 
 
 
329 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  40.28 
 
 
321 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  36.96 
 
 
328 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  36.96 
 
 
328 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  41.47 
 
 
316 aa  236  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  39.17 
 
 
329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  40 
 
 
326 aa  232  8.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  39.81 
 
 
364 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  38.41 
 
 
322 aa  229  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  41.31 
 
 
324 aa  229  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  37.27 
 
 
333 aa  229  6e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  43.37 
 
 
331 aa  229  7e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  39.24 
 
 
334 aa  228  8e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  39.75 
 
 
333 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  40.07 
 
 
299 aa  227  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  36.36 
 
 
326 aa  226  4e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  41.67 
 
 
361 aa  226  6e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  41.5 
 
 
368 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  38.41 
 
 
332 aa  222  6e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  37.58 
 
 
325 aa  222  6e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2541  biotin synthase  36.62 
 
 
337 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179392  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  38.2 
 
 
368 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  39.12 
 
 
328 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  37.89 
 
 
368 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  37.78 
 
 
331 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  33.64 
 
 
370 aa  214  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1435  biotin synthase  36.57 
 
 
327 aa  209  4e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183377  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  35.91 
 
 
359 aa  208  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  35.24 
 
 
364 aa  208  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  35.89 
 
 
332 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0244  Biotin synthase  38.92 
 
 
319 aa  207  2e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.003005  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  36.96 
 
 
388 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  36.59 
 
 
332 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  36.28 
 
 
376 aa  207  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  36.24 
 
 
332 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  36.24 
 
 
332 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  36.24 
 
 
332 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  36.24 
 
 
332 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  35.67 
 
 
341 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  36.24 
 
 
332 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  36.24 
 
 
332 aa  205  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  36.24 
 
 
332 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0353  biotin synthase  36.6 
 
 
327 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  37.54 
 
 
361 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  32.52 
 
 
375 aa  204  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  37.88 
 
 
361 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  36.24 
 
 
332 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  36.24 
 
 
332 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  37.54 
 
 
361 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  36.02 
 
 
370 aa  203  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  36.21 
 
 
344 aa  202  8e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  35.31 
 
 
321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03970  biotin synthase, putative  37.79 
 
 
388 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.299072  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  35.05 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  36.6 
 
 
345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  31.95 
 
 
338 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0352  biotin synthase  33.77 
 
 
326 aa  196  6e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.643225  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06643  biotin synthase (Eurofung)  35.6 
 
 
393 aa  195  9e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  36.36 
 
 
333 aa  194  1e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  34.7 
 
 
335 aa  194  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  34.7 
 
 
335 aa  194  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  32.79 
 
 
324 aa  194  2e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  34.08 
 
 
349 aa  192  6e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  34.81 
 
 
345 aa  192  9e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1571  biotin synthase  36.55 
 
 
411 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal  0.287862 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0492  biotin synthase  36.25 
 
 
328 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0618  biotin synthase  36.3 
 
 
327 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.743089  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0430  biotin synthase  36.25 
 
 
346 aa  191  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30955  Biotin synthase  34.26 
 
 
361 aa  191  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0547155 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  36.03 
 
 
336 aa  190  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0259  biotin synthase  34.22 
 
 
316 aa  189  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0436  biotin synthase  34.22 
 
 
316 aa  189  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726909 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  34.19 
 
 
335 aa  188  9e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  32.5 
 
 
352 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  33.33 
 
 
338 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2187  biotin synthase  33.13 
 
 
367 aa  187  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.80903  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1433  biotin synthase  35.2 
 
 
324 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0246  biotin synthase  32.69 
 
 
342 aa  187  3e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0078  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.22 
 
 
330 aa  186  4e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  34.25 
 
 
352 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2436  biotin synthase  34.65 
 
 
337 aa  186  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.113139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  34.7 
 
 
347 aa  185  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  34.65 
 
 
358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0484  biotin synthase  35.62 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.631061  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2557  biotin synthase  33.88 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000730416  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2916  biotin synthase  35.15 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  32.91 
 
 
331 aa  183  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3415  biotin synthase  34.81 
 
 
374 aa  183  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>