More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0489 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0489  SufBD protein  100 
 
 		 417 aa  851    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31169 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  34.45 
 
 		 445 aa  223  6e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  31.25 
 
 		 434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  29.18 
 
 		 444 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  29.2 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  29.67 
 
 		 435 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  27.48 
 
 		 450 aa  153  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  28.07 
 
 		 420 aa  146  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  28.71 
 
 		 440 aa  145  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  28.19 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  29.66 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  28.89 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  25.93 
 
 		 441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  26.59 
 
 		 447 aa  139  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  25 
 
 		 437 aa  139  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  26.08 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  25 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  26.57 
 
 		 442 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  28.79 
 
 		 439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4804  FeS assembly protein SufD  25.25 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  25 
 
 		 430 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4706  iron-regulated ABC transporter  25 
 
 		 430 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  25 
 
 		 430 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  29.48 
 
 		 455 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  25 
 
 		 430 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  25 
 
 		 430 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  27.4 
 
 		 437 aa  130  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  25 
 
 		 430 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  28.61 
 
 		 437 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5124  FeS assembly protein SufD  24.75 
 
 		 430 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.233215  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  29.98 
 
 		 451 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  0.0000000788125 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0412  FeS assembly protein SufD  25.62 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5087  FeS assembly protein SufD  24.57 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3578  FeS assembly protein SufD  25.25 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  28.81 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  24.94 
 
 		 439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  28.39 
 
 		 439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  28.61 
 
 		 437 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  28.57 
 
 		 445 aa  127  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1466  FeS assembly protein SufD  29.15 
 
 		 425 aa  126  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269271  normal  0.0505489 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  29.01 
 
 		 436 aa  126  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  24.32 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0927  FeS assembly protein SufD  26.45 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0933  hypothetical protein  26.45 
 
 		 425 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.478935  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3073  FeS assembly protein SufD  27.38 
 
 		 436 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  24.4 
 
 		 446 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  28.84 
 
 		 426 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2253  FeS assembly protein SufD  26.2 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1897  FeS assembly protein SufD  26.51 
 
 		 424 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363376 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01650  component of SufBCD complex  27.76 
 
 		 423 aa  123  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1762  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  27.39 
 
 		 423 aa  123  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0210181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01640  hypothetical protein  27.76 
 
 		 423 aa  123  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000779694  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  27.39 
 
 		 423 aa  124  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.05 
 
 		 423 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1950  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  27.39 
 
 		 423 aa  123  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0520002  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  25.12 
 
 		 438 aa  123  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1485  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  27.83 
 
 		 423 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206713 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  25.12 
 
 		 441 aa  122  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1346  FeS assembly protein SufD  27.83 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.641587  hitchhiker  0.00000000191252 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1469  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  27.8 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.866432  normal  0.0690013 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  27.76 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.252227  hitchhiker  0.00000429728 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2104  FeS assembly protein SufD  26.27 
 
 		 424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111297 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  27.39 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2395  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  27.88 
 
 		 423 aa  121  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087197  hitchhiker  0.000115041 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  29.06 
 
 		 430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1504  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  27.51 
 
 		 423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.429921  hitchhiker  0.0000000349756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4731  FeS assembly protein SufD  25.51 
 
 		 454 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0727  FeS assembly protein SufD  27.39 
 
 		 422 aa  119  7e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  25.13 
 
 		 439 aa  119  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1970  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  27.17 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000806248 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1697  FeS assembly protein SufD  29.38 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294615  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  26.6 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0812  FeS assembly protein SufD  23.81 
 
 		 421 aa  119  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0156327  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1961  FeS assembly protein SufD  27.25 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0846147  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2922  FeS assembly protein SufD  25.91 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0816  ABC transporter membrane protein  27.13 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  26.98 
 
 		 440 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  22.93 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  26.8 
 
 		 430 aa  117  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1763  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  27.14 
 
 		 423 aa  117  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.182167  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.02 
 
 		 448 aa  117  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2358  SufBD  24.94 
 
 		 430 aa  116  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  25.86 
 
 		 453 aa  116  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0174  SufBD protein  27.87 
 
 		 404 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1882  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.99 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.077757  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  25.39 
 
 		 428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0428  FeS assembly protein SufD  26.04 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0417  FeS assembly protein SufD  26.04 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  24.05 
 
 		 426 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  24.6 
 
 		 475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  24.18 
 
 		 426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  30.41 
 
 		 446 aa  114  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1850  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  27.48 
 
 		 441 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0513191  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  28.66 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.76 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  24.77 
 
 		 454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  26 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  23.32 
 
 		 433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  24.4 
 
 		 467 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0378  SufBD protein  26.57 
 
 		 403 aa  111  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0643358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>