93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0392 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 
709 aa  1470    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.98 
 
 
704 aa  546  1e-154  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  39.97 
 
 
704 aa  530  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  40.29 
 
 
690 aa  525  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.88 
 
 
698 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.25 
 
 
688 aa  462  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.23 
 
 
687 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  40.13 
 
 
581 aa  442  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  37.66 
 
 
638 aa  433  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.66 
 
 
487 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  40.75 
 
 
932 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  40.86 
 
 
750 aa  389  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  35.21 
 
 
463 aa  314  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  36.25 
 
 
470 aa  281  4e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  34.96 
 
 
606 aa  279  1e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  34.22 
 
 
460 aa  263  6e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  33.99 
 
 
460 aa  262  2e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  34.62 
 
 
434 aa  254  5.000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  35.83 
 
 
410 aa  252  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0640  F5/8 type C domain-containing protein  26.33 
 
 
436 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0652  F5/8 type C domain-containing protein  26.11 
 
 
436 aa  142  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0313432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.91 
 
 
467 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  30.15 
 
 
478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  26.55 
 
 
674 aa  115  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  31.09 
 
 
581 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  26.78 
 
 
445 aa  104  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  29.09 
 
 
435 aa  103  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  27.01 
 
 
435 aa  100  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  28.53 
 
 
441 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  27.81 
 
 
340 aa  98.6  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  27.5 
 
 
440 aa  98.6  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  26.8 
 
 
429 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  29.13 
 
 
452 aa  95.1  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  26.56 
 
 
431 aa  94.7  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  24.87 
 
 
429 aa  93.6  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  27.3 
 
 
596 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  27.83 
 
 
473 aa  92  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  26.9 
 
 
471 aa  90.9  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  36.91 
 
 
447 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  33.51 
 
 
450 aa  89  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  27.15 
 
 
627 aa  88.6  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  28.28 
 
 
473 aa  88.2  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  26.35 
 
 
479 aa  87.4  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  23.15 
 
 
538 aa  85.1  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  33.91 
 
 
711 aa  83.2  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  29.22 
 
 
479 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  24.92 
 
 
474 aa  82.4  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  26.28 
 
 
494 aa  82  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  24.3 
 
 
485 aa  82  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  30.17 
 
 
415 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.98 
 
 
1289 aa  80.5  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  36.91 
 
 
805 aa  77.8  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  29.13 
 
 
479 aa  73.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.57 
 
 
1264 aa  71.2  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  28.01 
 
 
446 aa  70.5  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  27.72 
 
 
446 aa  69.3  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  24.14 
 
 
463 aa  68.2  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  25.23 
 
 
446 aa  67.8  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  23.57 
 
 
482 aa  67.4  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  32.93 
 
 
2095 aa  67  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  31.76 
 
 
1471 aa  67  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  24.84 
 
 
490 aa  66.6  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  30.91 
 
 
2095 aa  61.2  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  27.04 
 
 
644 aa  60.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  26.87 
 
 
408 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  24.66 
 
 
484 aa  57.8  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  25.3 
 
 
534 aa  57.4  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4324  coagulation factor 5/8 type, C-terminal  32.68 
 
 
223 aa  56.6  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.010102  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  32.56 
 
 
1965 aa  56.2  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  26.12 
 
 
1967 aa  55.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  25.14 
 
 
464 aa  54.3  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1472  putative alpha-N-acetylgalactosaminidase  34.23 
 
 
1588 aa  54.3  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  24.43 
 
 
515 aa  53.9  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  34.07 
 
 
600 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  33 
 
 
212 aa  52.8  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  22.74 
 
 
532 aa  51.6  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  27.33 
 
 
1001 aa  50.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.11 
 
 
1329 aa  50.4  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1885  S-layer domain protein  27.2 
 
 
591 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726885  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  31.34 
 
 
1028 aa  48.9  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  34.12 
 
 
495 aa  48.9  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0803  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.33 
 
 
712 aa  48.1  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.969227  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  28.45 
 
 
466 aa  47  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  29.63 
 
 
731 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  23.96 
 
 
492 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2538  coagulation factor 5/8 type-like protein  26.47 
 
 
1043 aa  46.2  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  33.73 
 
 
505 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.99 
 
 
1448 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1817  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.02 
 
 
1787 aa  45.4  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.29404 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  21.07 
 
 
473 aa  45.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0197  endo-beta-N-acetylglucosaminidase D  37.8 
 
 
927 aa  44.7  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  24.83 
 
 
584 aa  44.7  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.65 
 
 
1139 aa  43.9  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>