More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0276 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0276  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 		 377 aa  783    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000356589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0175  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.95 
 
 		 381 aa  438  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.6 
 
 		 371 aa  420  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.6 
 
 		 373 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.95 
 
 		 370 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.28 
 
 		 370 aa  414  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.15 
 
 		 375 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.69 
 
 		 373 aa  408  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.83 
 
 		 372 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.03 
 
 		 369 aa  398  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.93 
 
 		 374 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1759  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 		 377 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 		 379 aa  393  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 		 379 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 		 379 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.88 
 
 		 368 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.69 
 
 		 373 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.7 
 
 		 370 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.49 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.07 
 
 		 370 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.51 
 
 		 379 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 387 aa  389  1e-107  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.51 
 
 		 379 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.51 
 
 		 379 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.51 
 
 		 379 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.51 
 
 		 379 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.78 
 
 		 379 aa  391  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.51 
 
 		 379 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.19 
 
 		 373 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.22 
 
 		 379 aa  391  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.78 
 
 		 379 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.97 
 
 		 372 aa  388  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.97 
 
 		 372 aa  388  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.78 
 
 		 379 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.69 
 
 		 395 aa  391  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.51 
 
 		 379 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.93 
 
 		 369 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.05 
 
 		 383 aa  385  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.96 
 
 		 376 aa  388  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.13 
 
 		 374 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.16 
 
 		 377 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 372 aa  386  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.05 
 
 		 383 aa  387  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.41 
 
 		 367 aa  387  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.13 
 
 		 380 aa  387  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.74 
 
 		 373 aa  386  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 		 380 aa  383  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6918  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.73 
 
 		 376 aa  381  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.625358  normal  0.464203 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.38 
 
 		 367 aa  383  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.13 
 
 		 380 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.89 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.43 
 
 		 386 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1430  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.21 
 
 		 376 aa  382  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143529  normal  0.876583 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3054  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.57 
 
 		 379 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0377683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0045  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.35 
 
 		 376 aa  382  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.06 
 
 		 380 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1985  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.94 
 
 		 376 aa  384  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.8 
 
 		 379 aa  383  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.53 
 
 		 382 aa  384  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.81 
 
 		 368 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.06 
 
 		 380 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4079  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.88 
 
 		 376 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.137728 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.21 
 
 		 369 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0964  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.13 
 
 		 377 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.19 
 
 		 380 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.66 
 
 		 384 aa  380  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.78 
 
 		 375 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1756  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.34 
 
 		 377 aa  375  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.185271  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00865  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 376 aa  377  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0712  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.58 
 
 		 377 aa  375  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.87 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 368 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2647  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.94 
 
 		 381 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000956702  hitchhiker  0.00180241 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1197  queuine tRNA-ribosyltransferase (tRNA-guanine transglycosylase)  50.54 
 
 		 376 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1315  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.93 
 
 		 376 aa  375  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3555  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.97 
 
 		 378 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.2 
 
 		 371 aa  371  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.89 
 
 		 374 aa  375  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.25 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.46 
 
 		 368 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1512  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.13 
 
 		 379 aa  372  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.24 
 
 		 365 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.46 
 
 		 368 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1866  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 		 380 aa  374  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000457262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1591  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.86 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00100827  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3359  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.04 
 
 		 377 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.142206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0500  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.81 
 
 		 376 aa  370  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.260336 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.14 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.73 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3733  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.17 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.812012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2592  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.32 
 
 		 377 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00946662  normal  0.321303 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 380 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 380 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.93 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.73 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2876  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.09 
 
 		 377 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.4 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2542  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.08 
 
 		 387 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.213207  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.36 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>