More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0247 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  58.09 
 
 		 557 aa  673    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  100 
 
 		 562 aa  1116    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  51.63 
 
 		 573 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0373  30S ribosomal protein S1  52.69 
 
 		 570 aa  559  1e-158  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0107492  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  49.28 
 
 		 596 aa  561  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  49.43 
 
 		 584 aa  537  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  51.25 
 
 		 568 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  51.25 
 
 		 568 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  49.43 
 
 		 584 aa  537  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  51.25 
 
 		 568 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  49.34 
 
 		 584 aa  535  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2301  30S ribosomal protein S1  51.06 
 
 		 578 aa  528  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  49.15 
 
 		 574 aa  526  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  46.32 
 
 		 604 aa  521  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1620  ribosomal protein S1  48.38 
 
 		 597 aa  514  1e-144  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  48.87 
 
 		 586 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2382  ribosomal protein S1  47.92 
 
 		 608 aa  511  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  47.91 
 
 		 579 aa  504  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  45.63 
 
 		 609 aa  500  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  46.01 
 
 		 574 aa  497  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  45.51 
 
 		 577 aa  498  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  45.25 
 
 		 577 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2963  30S ribosomal protein S1  44.57 
 
 		 593 aa  483  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000174303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2145  ribosomal protein S1  45.4 
 
 		 573 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000142665  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  45.72 
 
 		 575 aa  472  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2333  30S ribosomal protein S1  45.17 
 
 		 570 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000922659  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  45.1 
 
 		 720 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0570  30S ribosomal protein S1  43.15 
 
 		 592 aa  465  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2000  30S ribosomal protein S1  43.4 
 
 		 591 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000749746  normal  0.10797 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0452  30S ribosomal protein S1  42.78 
 
 		 592 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000961926  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1794  30S ribosomal protein S1  43.26 
 
 		 588 aa  460  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000217401  normal  0.053041 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0418  30S ribosomal protein S1  42.13 
 
 		 591 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000167097  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  44.27 
 
 		 559 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  45.01 
 
 		 576 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  45.01 
 
 		 570 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1732  30S ribosomal protein S1  43.36 
 
 		 589 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000125222  decreased coverage  0.00441133 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0349  30S ribosomal protein S1  43.04 
 
 		 586 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000135822  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  44.82 
 
 		 570 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  45.01 
 
 		 570 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1967  30S ribosomal protein S1  43.89 
 
 		 559 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  44.82 
 
 		 576 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23330  30S ribosomal protein S1  43.89 
 
 		 559 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000169607  hitchhiker  0.00388994 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  45.01 
 
 		 576 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  44.82 
 
 		 576 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0642  30S ribosomal protein S1  44.7 
 
 		 551 aa  449  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000269635  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  44.8 
 
 		 564 aa  452  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  43.88 
 
 		 571 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  43.77 
 
 		 564 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1854  30S ribosomal protein S1  44.21 
 
 		 560 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  44.07 
 
 		 589 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1535  30S ribosomal protein S1  44.7 
 
 		 555 aa  449  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00152799  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2796  30S ribosomal protein S1  44.71 
 
 		 561 aa  449  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.355849  hitchhiker  0.000269522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1363  30S ribosomal protein S1  45 
 
 		 558 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0329116  normal  0.0187285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1772  30S ribosomal protein S1  45 
 
 		 558 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  44.26 
 
 		 570 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0964  30S ribosomal protein S1  44.69 
 
 		 562 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  42.28 
 
 		 556 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  44.26 
 
 		 570 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  44.26 
 
 		 570 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  44.44 
 
 		 557 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3942  30S ribosomal protein S1  45 
 
 		 558 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121339  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0293  30S ribosomal protein S1  42.91 
 
 		 573 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  44.26 
 
 		 570 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  44.26 
 
 		 570 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  44.26 
 
 		 570 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1789  30S ribosomal protein S1  43.09 
 
 		 561 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123989 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  44.26 
 
 		 570 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1379  30S ribosomal protein S1  44.81 
 
 		 558 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2244  30S ribosomal protein S1  45.21 
 
 		 571 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.777167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  44.26 
 
 		 570 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1736  30S ribosomal protein S1  44.42 
 
 		 555 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000968358  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  43.88 
 
 		 577 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3285  30S ribosomal protein S1  44.16 
 
 		 561 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00279338  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1413  30S ribosomal protein S1  43.21 
 
 		 555 aa  443  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0578612  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1614  30S ribosomal protein S1  42.83 
 
 		 562 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  42.99 
 
 		 562 aa  443  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  43.66 
 
 		 558 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1750  ribosomal protein S1  42.99 
 
 		 563 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00710774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3642  30S ribosomal protein S1  42.99 
 
 		 563 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0546866  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2279  30S ribosomal protein S1  44.42 
 
 		 555 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000133831  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4724  30S ribosomal protein S1  43.78 
 
 		 561 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2066  30S ribosomal protein S1  44.42 
 
 		 555 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000984925  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2042  30S ribosomal protein S1  44.42 
 
 		 555 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000389287  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  44.07 
 
 		 569 aa  443  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  44.07 
 
 		 569 aa  443  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1753  30S ribosomal protein S1  44.62 
 
 		 555 aa  442  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374073  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2396  30S ribosomal protein S1  44.42 
 
 		 555 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000546021  unclonable  0.0000133254 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1924  30S ribosomal protein S1  44.42 
 
 		 555 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000191049  unclonable  0.0000000000752303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2054  30S ribosomal protein S1  44.42 
 
 		 555 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000199699  unclonable  0.0000339472 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2123  30S ribosomal protein S1  44.62 
 
 		 555 aa  442  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000359988  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1977  30S ribosomal protein S1  44.42 
 
 		 555 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000796646  unclonable  0.000000000124259 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2070  30S ribosomal protein S1  44.42 
 
 		 555 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000132225  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0149  30S ribosomal protein S1  43.86 
 
 		 569 aa  445  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1391  30S ribosomal protein S1  45.17 
 
 		 561 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00553115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2402  30S ribosomal protein S1  44.42 
 
 		 555 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4072  30S ribosomal protein S1  44.25 
 
 		 561 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000537264  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0500  30S ribosomal protein S1  43.89 
 
 		 557 aa  440  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.170768  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1566  30S ribosomal protein S1  43.36 
 
 		 566 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  42.99 
 
 		 562 aa  442  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.334273 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2163  30S ribosomal protein S1  43.27 
 
 		 559 aa  440  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0054934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>