More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0193 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  100 
 
 		 408 aa  845    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  57.49 
 
 		 404 aa  494  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.9 
 
 		 418 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.71 
 
 		 408 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  53.45 
 
 		 414 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.83 
 
 		 451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.48 
 
 		 412 aa  441  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.73 
 
 		 406 aa  444  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  53 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.7 
 
 		 404 aa  443  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.49 
 
 		 404 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  50.99 
 
 		 419 aa  440  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.75 
 
 		 429 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.81 
 
 		 425 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  52.62 
 
 		 420 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.23 
 
 		 415 aa  435  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  50.73 
 
 		 423 aa  433  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  49.88 
 
 		 405 aa  434  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  49.88 
 
 		 405 aa  433  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  51.75 
 
 		 420 aa  430  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  49.88 
 
 		 412 aa  422  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.61 
 
 		 420 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.98 
 
 		 413 aa  422  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.37 
 
 		 406 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.38 
 
 		 404 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  48.65 
 
 		 404 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  47.38 
 
 		 405 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  51.8 
 
 		 412 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  49.88 
 
 		 405 aa  415  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1347  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.14 
 
 		 405 aa  413  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  hitchhiker  0.000000000139909 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  48.65 
 
 		 420 aa  413  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  51.25 
 
 		 422 aa  413  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.88 
 
 		 774 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.23 
 
 		 421 aa  412  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  50 
 
 		 417 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.75 
 
 		 414 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.03 
 
 		 419 aa  409  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.04 
 
 		 419 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  47.91 
 
 		 403 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.51 
 
 		 416 aa  409  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.01 
 
 		 429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.52 
 
 		 413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.75 
 
 		 427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.79 
 
 		 419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  48.01 
 
 		 406 aa  403  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  48.01 
 
 		 406 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  48.01 
 
 		 406 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  48.01 
 
 		 406 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  48.01 
 
 		 406 aa  403  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  48.01 
 
 		 406 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  51.46 
 
 		 417 aa  402  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.5 
 
 		 412 aa  402  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  49.14 
 
 		 408 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.51 
 
 		 406 aa  402  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  48.01 
 
 		 406 aa  403  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.8 
 
 		 413 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  47.76 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.51 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  47.76 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.37 
 
 		 444 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.49 
 
 		 641 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  47.78 
 
 		 413 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.42 
 
 		 406 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.88 
 
 		 416 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.13 
 
 		 621 aa  395  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.88 
 
 		 662 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  45.11 
 
 		 425 aa  397  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  47.13 
 
 		 604 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  47.13 
 
 		 604 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.63 
 
 		 678 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19482  cysteine desulfurase for iron-sulfur cluster formation suf  48.74 
 
 		 496 aa  394  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.88 
 
 		 605 aa  391  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.4 
 
 		 412 aa  392  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.88 
 
 		 630 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.92 
 
 		 414 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.13 
 
 		 418 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.13 
 
 		 414 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.32 
 
 		 420 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.39 
 
 		 408 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.13 
 
 		 418 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.13 
 
 		 414 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.55 
 
 		 417 aa  386  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  49.63 
 
 		 406 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  47.68 
 
 		 414 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  48.26 
 
 		 626 aa  385  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.08 
 
 		 418 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  49.38 
 
 		 406 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  49.63 
 
 		 406 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03290  hypothetical protein  46.44 
 
 		 403 aa  388  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  49.63 
 
 		 406 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  46.88 
 
 		 410 aa  385  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  49.25 
 
 		 406 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.03 
 
 		 679 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  47.38 
 
 		 661 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.88 
 
 		 608 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.88 
 
 		 657 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  48.51 
 
 		 416 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  47.19 
 
 		 414 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  49.13 
 
 		 406 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>