More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0170 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  56.31 
 
 
533 aa  636    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  57.14 
 
 
536 aa  635    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  63.21 
 
 
554 aa  708    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  55.26 
 
 
541 aa  636    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  56.05 
 
 
538 aa  636    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  56.74 
 
 
535 aa  637    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  57.52 
 
 
538 aa  641    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  57.69 
 
 
537 aa  638    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0170  CTP synthetase  100 
 
 
535 aa  1105    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.357981 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  56.31 
 
 
542 aa  640    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  58.6 
 
 
545 aa  649    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  55.93 
 
 
540 aa  632  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  57.17 
 
 
547 aa  629  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  55.85 
 
 
534 aa  630  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  55.09 
 
 
531 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  55.18 
 
 
535 aa  628  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  55.18 
 
 
535 aa  628  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  55.93 
 
 
557 aa  629  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  55.78 
 
 
534 aa  627  1e-178  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  57.09 
 
 
533 aa  626  1e-178  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  55.95 
 
 
530 aa  625  1e-178  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  55.97 
 
 
533 aa  626  1e-178  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  54.8 
 
 
532 aa  625  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  55.56 
 
 
534 aa  626  1e-178  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  55.26 
 
 
542 aa  625  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  57.63 
 
 
534 aa  626  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  56.75 
 
 
551 aa  626  1e-178  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  55.72 
 
 
534 aa  625  1e-178  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  55.97 
 
 
533 aa  624  1e-177  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  55.83 
 
 
535 aa  622  1e-177  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  54.41 
 
 
537 aa  624  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  56.82 
 
 
548 aa  622  1e-177  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  54.61 
 
 
535 aa  624  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  56.38 
 
 
540 aa  622  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  55.39 
 
 
531 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  56.07 
 
 
542 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  56.07 
 
 
542 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  54.24 
 
 
535 aa  621  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  54.05 
 
 
535 aa  619  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  54.43 
 
 
535 aa  620  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  54.43 
 
 
535 aa  621  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  54.05 
 
 
535 aa  618  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  54.24 
 
 
535 aa  619  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  54.7 
 
 
547 aa  619  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  54.87 
 
 
536 aa  620  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  54.43 
 
 
535 aa  621  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  55.35 
 
 
543 aa  620  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  54.24 
 
 
535 aa  619  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  54.78 
 
 
534 aa  618  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  54.87 
 
 
536 aa  620  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  54.24 
 
 
535 aa  619  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  57.58 
 
 
533 aa  618  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  54.15 
 
 
533 aa  621  1e-176  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  55.3 
 
 
557 aa  615  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  55.39 
 
 
543 aa  617  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  57.01 
 
 
547 aa  617  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  53.86 
 
 
535 aa  617  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  57.58 
 
 
533 aa  617  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  54.61 
 
 
533 aa  616  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  56.03 
 
 
555 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  55.66 
 
 
555 aa  617  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  56.74 
 
 
555 aa  617  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  54.51 
 
 
547 aa  617  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  54.6 
 
 
542 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  56.98 
 
 
552 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  54.6 
 
 
542 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  54.17 
 
 
546 aa  612  9.999999999999999e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  55.81 
 
 
535 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  54.41 
 
 
542 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1000  CTP synthetase  55.13 
 
 
552 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  54.39 
 
 
558 aa  611  9.999999999999999e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  54.6 
 
 
542 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  53.4 
 
 
538 aa  612  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  53.76 
 
 
539 aa  610  1e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  55.33 
 
 
537 aa  610  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  55.45 
 
 
555 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  55.72 
 
 
543 aa  608  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  55.95 
 
 
536 aa  608  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  54.31 
 
 
543 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  53.28 
 
 
545 aa  605  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  54.78 
 
 
543 aa  607  9.999999999999999e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  54.6 
 
 
542 aa  605  9.999999999999999e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  54.7 
 
 
542 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  55.39 
 
 
547 aa  605  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  55.58 
 
 
551 aa  607  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2845  CTP synthetase  55.33 
 
 
555 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1614  CTP synthetase  56.52 
 
 
535 aa  608  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.23037  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0915  CTP synthetase  54.76 
 
 
552 aa  608  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5105  CTP synthetase  54.21 
 
 
552 aa  604  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  54.31 
 
 
543 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  54.98 
 
 
549 aa  604  1.0000000000000001e-171  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  54.98 
 
 
542 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  54.17 
 
 
545 aa  603  1.0000000000000001e-171  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  54.04 
 
 
550 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  53.96 
 
 
534 aa  603  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  54.08 
 
 
549 aa  601  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  55.45 
 
 
555 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  55.45 
 
 
555 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  54.53 
 
 
555 aa  601  1.0000000000000001e-171  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  53.22 
 
 
553 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>