101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0134 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0134  peptidase M28  100 
 
 
314 aa  656    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0003  peptidase M28  30 
 
 
319 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3904  peptidase M28  29.87 
 
 
344 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.581158  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2681  peptidase M28  27.74 
 
 
325 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0856  peptidase M28  27.44 
 
 
336 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1913  peptidase M28  30.36 
 
 
304 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2157  glutamine cyclotransferase-related protein  27.52 
 
 
333 aa  90.5  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7526  hypothetical protein  27.05 
 
 
318 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1835  peptidase M28  30.41 
 
 
315 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  26.58 
 
 
775 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5551  peptidase M28  26.54 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3417  leucine aminopeptidase  25.39 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02870  conserved hypothetical protein  26.94 
 
 
402 aa  75.9  0.0000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  30.18 
 
 
947 aa  72.4  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01706  glutaminyl cyclase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08280)  28.97 
 
 
461 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.592246 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1040  peptidase M28  23.29 
 
 
320 aa  70.1  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  27.65 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  31.61 
 
 
519 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0768  hypothetical protein  24.58 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  29.15 
 
 
518 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  34.03 
 
 
333 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  27.36 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  27.35 
 
 
334 aa  56.2  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  28.33 
 
 
466 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  29.69 
 
 
1147 aa  55.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  30.5 
 
 
391 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  26.84 
 
 
282 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2824  peptidase M28  25.45 
 
 
771 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264014  normal  0.0144765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  28.57 
 
 
309 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  27.9 
 
 
466 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  27.9 
 
 
465 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  27.9 
 
 
466 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  27.9 
 
 
466 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  27.9 
 
 
466 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  27.9 
 
 
466 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  27.32 
 
 
625 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  28.21 
 
 
313 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  26.38 
 
 
394 aa  52.8  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  26.74 
 
 
319 aa  52.8  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  25.79 
 
 
437 aa  52.8  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  28.1 
 
 
1077 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  25.51 
 
 
373 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  26.87 
 
 
466 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  29.25 
 
 
407 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17180  predicted aminopeptidase  24.92 
 
 
747 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00826733  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  30.17 
 
 
502 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  39.74 
 
 
555 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  29.29 
 
 
440 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  27.37 
 
 
342 aa  50.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  29.41 
 
 
447 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  29.41 
 
 
447 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  35.71 
 
 
339 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4460  aminopeptidase  24.29 
 
 
794 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000347887  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  31.29 
 
 
674 aa  49.3  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  29.12 
 
 
312 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8611  peptidase M28  29.65 
 
 
764 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0628073  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  27.04 
 
 
466 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  27.04 
 
 
466 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  27.75 
 
 
368 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  26.84 
 
 
466 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  29.8 
 
 
549 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4970  aminopeptidase-like protein  36.96 
 
 
442 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  38.75 
 
 
330 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  27.12 
 
 
944 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  34.65 
 
 
341 aa  46.2  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  28.08 
 
 
550 aa  46.2  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  27.5 
 
 
555 aa  46.2  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1386  peptidase M28  31.08 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2420  M28A family peptidase  31.08 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.564351  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2428  M28 family peptidase  30.87 
 
 
273 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  29.29 
 
 
552 aa  45.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  29.29 
 
 
552 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  31.55 
 
 
584 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  29.17 
 
 
518 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  31.4 
 
 
490 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0513  peptidase M28  39.39 
 
 
341 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  32.14 
 
 
558 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  32.14 
 
 
558 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0187  peptidase M28  29.9 
 
 
356 aa  44.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  23.84 
 
 
346 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  28.86 
 
 
424 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  23.91 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  27.54 
 
 
346 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5420  peptidase M28  33.03 
 
 
759 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  34.78 
 
 
574 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  30.43 
 
 
597 aa  43.5  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  36.11 
 
 
558 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  29.19 
 
 
450 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  35 
 
 
315 aa  43.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  36.11 
 
 
558 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  35.11 
 
 
510 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3548  aminopeptidase Y  33.85 
 
 
555 aa  43.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0650469 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  29.51 
 
 
352 aa  43.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  29.35 
 
 
1103 aa  43.1  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  34.26 
 
 
386 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  34.26 
 
 
393 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  34.26 
 
 
398 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  25.83 
 
 
512 aa  42.7  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  23.61 
 
 
1247 aa  42.7  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  33.04 
 
 
488 aa  42.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>