More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0104 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
454 aa  931    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  51.2 
 
 
715 aa  450  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  40.66 
 
 
406 aa  335  1e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  39.34 
 
 
406 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  39.56 
 
 
406 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  38.55 
 
 
405 aa  310  4e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  39.43 
 
 
408 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  36.61 
 
 
400 aa  297  3e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  38.38 
 
 
409 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  38.38 
 
 
409 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  38.67 
 
 
707 aa  295  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  41.37 
 
 
409 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  39.21 
 
 
402 aa  293  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  38.16 
 
 
409 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  37.47 
 
 
400 aa  291  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  37.5 
 
 
406 aa  290  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  35.4 
 
 
658 aa  289  8e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  37.72 
 
 
400 aa  288  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  41.96 
 
 
409 aa  288  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  36.79 
 
 
402 aa  288  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  37.67 
 
 
403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  40.9 
 
 
409 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  35.54 
 
 
401 aa  282  9e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  34.08 
 
 
406 aa  282  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  40.9 
 
 
409 aa  282  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  36.47 
 
 
401 aa  281  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  37.53 
 
 
657 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  35.96 
 
 
401 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  36.78 
 
 
402 aa  278  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  36.78 
 
 
402 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  36.2 
 
 
653 aa  277  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  36.4 
 
 
403 aa  277  2e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  41.52 
 
 
409 aa  277  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  36.64 
 
 
656 aa  276  6e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  36.4 
 
 
401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  36.4 
 
 
401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  37.04 
 
 
409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  38.41 
 
 
657 aa  272  9e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  35.7 
 
 
402 aa  270  5e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  34.36 
 
 
405 aa  268  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  37.1 
 
 
406 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  35.76 
 
 
670 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  36.24 
 
 
412 aa  266  5e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  35.04 
 
 
411 aa  265  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  37.72 
 
 
404 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  36.55 
 
 
657 aa  262  1e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  33.87 
 
 
456 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  39.04 
 
 
405 aa  259  7e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  35.37 
 
 
400 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  35.23 
 
 
400 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  35.24 
 
 
391 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2608  hypothetical protein  36.34 
 
 
411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  35.93 
 
 
409 aa  249  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  35.25 
 
 
644 aa  249  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  36.55 
 
 
405 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  35.95 
 
 
403 aa  245  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  36.55 
 
 
405 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2149  hypothetical protein  35.28 
 
 
402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531927  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  35.78 
 
 
403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  37.72 
 
 
408 aa  244  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  33.78 
 
 
443 aa  243  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  34.29 
 
 
405 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1452  hypothetical protein  36.32 
 
 
410 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  36.67 
 
 
407 aa  238  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  35.18 
 
 
405 aa  237  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  34.6 
 
 
661 aa  236  9e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  33.55 
 
 
647 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  33.85 
 
 
405 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  33.85 
 
 
405 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  34.18 
 
 
418 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  33.78 
 
 
671 aa  233  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  36.67 
 
 
653 aa  233  6e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  35.1 
 
 
405 aa  232  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  34.62 
 
 
412 aa  231  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  34.07 
 
 
648 aa  229  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2039  hypothetical protein  34.54 
 
 
403 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  34.01 
 
 
409 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  32.89 
 
 
405 aa  227  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  34.06 
 
 
648 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  34.06 
 
 
648 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  32.76 
 
 
656 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34 
 
 
678 aa  224  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  34 
 
 
678 aa  224  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  34 
 
 
678 aa  223  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  32.7 
 
 
417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  32.54 
 
 
682 aa  223  7e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  34 
 
 
696 aa  223  7e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  32.54 
 
 
682 aa  222  9e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  32.74 
 
 
642 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  34.07 
 
 
410 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  32.76 
 
 
667 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  32.33 
 
 
667 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.85 
 
 
649 aa  219  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  34 
 
 
423 aa  219  7e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.63 
 
 
649 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.11 
 
 
656 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  33.04 
 
 
410 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  33.41 
 
 
647 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  32.09 
 
 
649 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  33.18 
 
 
409 aa  214  2.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>