More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0059 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02482  protein disaggregation chaperone  43.63 
 
 
857 aa  691    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000328184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1080  ATP-dependent chaperone ClpB  43.63 
 
 
857 aa  691    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000145981  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0559  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  56.42 
 
 
870 aa  904    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0057  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  50.78 
 
 
824 aa  797    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00724799  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  48.04 
 
 
812 aa  763    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3316  chaperone-associated ATPase, putative  43.51 
 
 
940 aa  684    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2036  AAA family ATPase  44.62 
 
 
832 aa  719    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2327  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.98 
 
 
859 aa  694    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  52.29 
 
 
817 aa  882    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  54.33 
 
 
811 aa  885    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3913  ATP-dependent chaperone protein ClpB  42.26 
 
 
861 aa  686    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3577  clpB protein  44.07 
 
 
857 aa  693    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0829  clpB protein  44.37 
 
 
854 aa  690    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  54.33 
 
 
811 aa  885    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  54.33 
 
 
811 aa  885    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  54.21 
 
 
811 aa  885    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  42.75 
 
 
858 aa  686    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  42.75 
 
 
858 aa  687    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0728  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  43.38 
 
 
854 aa  684    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803675  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0200  ATPase  44.51 
 
 
867 aa  686    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.371355  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  51.99 
 
 
830 aa  858    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  49.02 
 
 
855 aa  853    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5916  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  45.72 
 
 
942 aa  694    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189322  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0589  AAA ATPase  42.81 
 
 
891 aa  693    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.917819  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0132  ATPase  44.94 
 
 
873 aa  740    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  51.95 
 
 
823 aa  852    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  43.93 
 
 
872 aa  709    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  50.18 
 
 
814 aa  821    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6998  putative ClpA/B protease, ATPase subunit  44.42 
 
 
949 aa  686    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5148  AAA ATPase, ClpB  43.78 
 
 
865 aa  686    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.830586  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1932  ATPase  51.49 
 
 
847 aa  842    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.356612  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  43.6 
 
 
862 aa  701    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  49.06 
 
 
843 aa  833    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1484  ATPase  51.07 
 
 
863 aa  791    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1007  ATPase  44.18 
 
 
862 aa  684    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.783787 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  49.01 
 
 
846 aa  838    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2851  AAA ATPase  44.4 
 
 
864 aa  698    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000473406  hitchhiker  0.00000000124432 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3413  ATPase  43.38 
 
 
949 aa  690    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0114965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  54.33 
 
 
811 aa  885    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  50 
 
 
842 aa  847    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  51.23 
 
 
824 aa  847    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1089  ATPase  44.31 
 
 
883 aa  715    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000277828 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0753  chaperone clpB  43.73 
 
 
870 aa  684    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0162  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  54.32 
 
 
840 aa  844    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2205  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  44 
 
 
865 aa  683    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.489947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0385  AAA ATPase, ClpA/B  46.06 
 
 
870 aa  714    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  53 
 
 
834 aa  872    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4247  AAA_5 ATPase  42.53 
 
 
879 aa  694    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0997657  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1170  ATPase AAA-2  43.96 
 
 
949 aa  699    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.501064  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1887  putative ATP-dependent Clp protease, ATP- binding subunit  45.04 
 
 
961 aa  689    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135075  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2374  heat-shock protein, chaperone ClpB  44.21 
 
 
865 aa  701    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0849473  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0499  ATPase AAA-2  42.73 
 
 
860 aa  689    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333931  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0681  ATPase AAA-2  42.07 
 
 
878 aa  683    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.310186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3573  ATPase AAA-2  49.32 
 
 
818 aa  773    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307239  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4765  ATPase AAA-2  44.46 
 
 
878 aa  705    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000533628  normal  0.0145469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0406  ATPase AAA-2  43.4 
 
 
862 aa  692    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2391  ATPase AAA-2  42.38 
 
 
859 aa  686    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1406  ATPase AAA-2  44.69 
 
 
946 aa  689    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6232  ATPase AAA-2  44 
 
 
865 aa  690    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0478  ATPase AAA-2  45.05 
 
 
848 aa  689    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  51.65 
 
 
847 aa  837    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  49.21 
 
 
837 aa  730    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0676  ATPase AAA-2  47.67 
 
 
886 aa  734    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000220966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  51.7 
 
 
834 aa  875    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1079  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  51.3 
 
 
848 aa  829    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2751  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  48.73 
 
 
814 aa  785    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2437  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  48.49 
 
 
814 aa  781    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  51.34 
 
 
825 aa  852    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  49.45 
 
 
825 aa  825    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0669  ATPase  43.96 
 
 
865 aa  686    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0949399  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  52.11 
 
 
828 aa  860    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1785  ATPase  43.78 
 
 
865 aa  690    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5668  ATPase  44.01 
 
 
953 aa  689    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2575  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06000  putative ClpA/B protease ATP binding subunit  44.77 
 
 
850 aa  693    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0160864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60190  clpB protein  44.73 
 
 
854 aa  694    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00250267  hitchhiker  0.00000000231015 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0666  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  43.77 
 
 
816 aa  700    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.483496  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0514  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  45.43 
 
 
823 aa  763    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.262133  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0283  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  47.21 
 
 
838 aa  759    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.114568  hitchhiker  0.0000140649 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0185  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  48.07 
 
 
826 aa  762    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  52.17 
 
 
830 aa  855    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1847  ATPase  44 
 
 
865 aa  690    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6423  ATPase  44.69 
 
 
946 aa  689    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.707526  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0263  ATPase  44.1 
 
 
873 aa  696    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.602009  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  52.36 
 
 
839 aa  878    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1737  ATPase  44.35 
 
 
873 aa  696    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0334  ATPase  50.58 
 
 
854 aa  849    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  52.38 
 
 
861 aa  865    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0489  ATPase  45.05 
 
 
848 aa  689    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  51.65 
 
 
847 aa  837    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0659  ATPase  44.7 
 
 
848 aa  686    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.582128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  51 
 
 
847 aa  858    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0880  ATPase  43.74 
 
 
859 aa  699    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0343543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3393  ATPase  43.49 
 
 
949 aa  694    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246292  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  49.4 
 
 
842 aa  843    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  49.28 
 
 
843 aa  840    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  49.13 
 
 
855 aa  855    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  47.95 
 
 
859 aa  838    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18321  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  43.99 
 
 
863 aa  690    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.207261 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  52.86 
 
 
818 aa  895    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0467  ATPase  45.05 
 
 
848 aa  689    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>