More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0044 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 274 aa  560  1.0000000000000001e-159  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  41.67 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  41.75 
 
 		 287 aa  207  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  45.29 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12773  Diaminopimelate epimerase  40.43 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  40.42 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  41.39 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  42.09 
 
 		 272 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  41.37 
 
 		 261 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  41.3 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  39.27 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0648  diaminopimelate epimerase  41.91 
 
 		 279 aa  186  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.312023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  40.64 
 
 		 292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  40.94 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1297  diaminopimelate epimerase  43.68 
 
 		 282 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0270469  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1614  diaminopimelate epimerase  42.09 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  38.55 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  40.36 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1977  diaminopimelate epimerase  40.88 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00347642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1798  diaminopimelate epimerase  44.04 
 
 		 283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000300974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0208  diaminopimelate epimerase  38.63 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  38.85 
 
 		 274 aa  166  4e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0304  diaminopimelate epimerase  38.08 
 
 		 256 aa  165  9e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.684099  hitchhiker  0.00244199 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  35.99 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0805  hypothetical protein  38.18 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15567 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  37.88 
 
 		 290 aa  162  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  34.97 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  36.08 
 
 		 276 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0561  diaminopimelate epimerase  41.97 
 
 		 282 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183817 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 275 aa  159  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 275 aa  159  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 275 aa  158  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  36.71 
 
 		 275 aa  158  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  35.99 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 284 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 284 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  37.76 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  36.97 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  35.89 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  35.89 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  36.01 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  35.89 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  36.62 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  35.89 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  35.64 
 
 		 278 aa  153  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  38.49 
 
 		 276 aa  153  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4129  diaminopimelate epimerase  38 
 
 		 280 aa  152  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.583012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  37.84 
 
 		 288 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  35.29 
 
 		 282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  35.31 
 
 		 280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0445  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  35.64 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  34.38 
 
 		 281 aa  149  5e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  35.47 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  35.57 
 
 		 289 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  35.47 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 281 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  34.84 
 
 		 276 aa  148  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  37 
 
 		 299 aa  148  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  34.15 
 
 		 323 aa  148  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0899  diaminopimelate epimerase  36 
 
 		 294 aa  148  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  36.15 
 
 		 387 aa  148  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  35 
 
 		 269 aa  148  9e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  34.93 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  37.12 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  37.68 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  37.76 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  34.97 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  37.76 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  38.15 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  36.93 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  34.36 
 
 		 280 aa  146  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0487  diaminopimelate epimerase  35.91 
 
 		 279 aa  146  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.111776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  35.14 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  35.14 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0063  diaminopimelate epimerase  38.93 
 
 		 273 aa  145  6e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  34.83 
 
 		 278 aa  145  6e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  34.9 
 
 		 289 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0391  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0113  diaminopimelate epimerase  32.99 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067838  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2069  diaminopimelate epimerase  32.99 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000531715  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1516  diaminopimelate epimerase  38.71 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3249  diaminopimelate epimerase  37.41 
 
 		 275 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  35.25 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  36.73 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  36.43 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  35.76 
 
 		 368 aa  143  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  37.07 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  36.14 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  34.63 
 
 		 283 aa  142  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  34.9 
 
 		 315 aa  142  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2542  diaminopimelate epimerase  36.24 
 
 		 277 aa  142  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2994  diaminopimelate epimerase  35.05 
 
 		 282 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0384566 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  34.03 
 
 		 281 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0859  diaminopimelate epimerase  36.49 
 
 		 275 aa  142  9e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1883  diaminopimelate epimerase  36.95 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  34.9 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  34.33 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1702  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 		 249 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>