More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0003 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  100 
 
 
311 aa  639    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  47.91 
 
 
325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  44.37 
 
 
369 aa  287  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  45.66 
 
 
316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  45.86 
 
 
320 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  45.86 
 
 
320 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  46.91 
 
 
319 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  45.83 
 
 
310 aa  276  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  45.54 
 
 
331 aa  276  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  45.02 
 
 
317 aa  273  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  43.27 
 
 
315 aa  272  4.0000000000000004e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  45.69 
 
 
344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  44.19 
 
 
341 aa  267  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  45.02 
 
 
328 aa  264  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  44.48 
 
 
315 aa  257  2e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  43.09 
 
 
360 aa  255  6e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  41.77 
 
 
336 aa  252  7e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  44.69 
 
 
317 aa  250  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  44.16 
 
 
308 aa  249  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  43.73 
 
 
307 aa  245  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  54.07 
 
 
236 aa  244  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  42.36 
 
 
323 aa  244  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  41.88 
 
 
303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.72 
 
 
301 aa  242  5e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  41.94 
 
 
308 aa  242  6e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.66 
 
 
307 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  42.77 
 
 
305 aa  239  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  38.78 
 
 
331 aa  239  5.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  42.43 
 
 
305 aa  237  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  40.71 
 
 
329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  42.86 
 
 
298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  42.48 
 
 
322 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  42.72 
 
 
299 aa  232  5e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 
316 aa  230  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  42.77 
 
 
306 aa  230  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  40.97 
 
 
310 aa  229  6e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  43.73 
 
 
307 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  39.87 
 
 
312 aa  228  7e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  40.97 
 
 
314 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  49.32 
 
 
240 aa  226  5.0000000000000005e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  37.74 
 
 
309 aa  222  6e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  46.52 
 
 
306 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  39.55 
 
 
308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  51.9 
 
 
235 aa  219  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  39.35 
 
 
308 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  39.37 
 
 
317 aa  217  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  48.87 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  38.91 
 
 
339 aa  215  7e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2909  ABC transporter related  48.42 
 
 
245 aa  206  5e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  39.42 
 
 
311 aa  205  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  46.41 
 
 
325 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  37.46 
 
 
317 aa  203  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  48.54 
 
 
247 aa  202  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  35.81 
 
 
314 aa  202  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  38.46 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  42.99 
 
 
308 aa  196  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  37.58 
 
 
309 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  35.26 
 
 
337 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  37.75 
 
 
324 aa  193  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  33.76 
 
 
309 aa  193  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  37.34 
 
 
314 aa  192  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  36.93 
 
 
309 aa  192  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  39.16 
 
 
312 aa  190  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  33.65 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  35.78 
 
 
316 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  40.32 
 
 
309 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  35.76 
 
 
308 aa  186  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.28 
 
 
309 aa  186  4e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.6 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  35.29 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.98 
 
 
343 aa  183  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  36.07 
 
 
314 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2058  ABC transporter, ATPase subunit  35.35 
 
 
291 aa  182  7e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  36.89 
 
 
334 aa  182  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  35.65 
 
 
305 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  38.64 
 
 
305 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  42.6 
 
 
327 aa  179  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  34.39 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  34.62 
 
 
290 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  43.27 
 
 
289 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  41.96 
 
 
578 aa  179  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  35.6 
 
 
338 aa  179  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  37.46 
 
 
305 aa  178  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  34.48 
 
 
319 aa  178  9e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2298  ABC transporter related  34.48 
 
 
316 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00283386  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.55 
 
 
330 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2246  ABC transporter related  34.28 
 
 
316 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  36.19 
 
 
301 aa  178  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  37.84 
 
 
270 aa  177  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  35.97 
 
 
320 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  35.69 
 
 
314 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.94 
 
 
333 aa  177  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  34.39 
 
 
316 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  39.66 
 
 
244 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.46 
 
 
327 aa  176  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  35.06 
 
 
318 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  35.29 
 
 
313 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.65 
 
 
305 aa  176  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.3 
 
 
318 aa  176  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  38.31 
 
 
305 aa  176  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>