More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0001 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0001  NUDIX hydrolase  100 
 
 
186 aa  382  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.621893  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04580  nudix hydrolase family protein  44.69 
 
 
183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0696  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 
184 aa  143  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.257627 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0849  NUDIX hydrolase  42.01 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.874704  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0967  ADP-ribose pyrophosphatase  41.42 
 
 
183 aa  137  7e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3451  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
173 aa  125  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.824912  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0876  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 
180 aa  106  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0374546  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1460  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 
176 aa  92.8  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  35.91 
 
 
180 aa  91.3  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0988  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
182 aa  89  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.871261  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 
180 aa  85.5  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  32.16 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
195 aa  81.3  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  33.51 
 
 
199 aa  80.9  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  40 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  32.07 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  32.14 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  32.74 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 
281 aa  78.6  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  32.14 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  39.84 
 
 
210 aa  77  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 
169 aa  77.4  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  29.48 
 
 
183 aa  77  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  43.62 
 
 
210 aa  74.3  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 
184 aa  74.3  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 
199 aa  74.3  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  30.73 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  30.54 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  38.68 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  33.79 
 
 
214 aa  72  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  32.16 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  31.17 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0740  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  29.47 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  32.96 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  28.65 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  30.82 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  30.86 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  32.02 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  35.57 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  42.39 
 
 
213 aa  67.8  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  30.65 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 
177 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
171 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 
194 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 
186 aa  67  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  28.4 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  29.05 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  38.83 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2962  NUDIX hydrolase  30.12 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.510189 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  30.29 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  30.29 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  30.29 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  32 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6151  NUDIX hydrolase  30.2 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389113  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  27.71 
 
 
193 aa  64.3  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  40.43 
 
 
179 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  40.43 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  40.43 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  40.43 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  40.43 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1651  NUDIX hydrolase  36 
 
 
163 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  40.43 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 
196 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  40.43 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3214  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.157336  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  41.49 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 
196 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  40.43 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0129  ADP-ribose diphosphatase NudE  40.5 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4044  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  29.71 
 
 
199 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1808  NUDIX hydrolase  37.34 
 
 
193 aa  63.2  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.801107  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>