More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7098 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  100 
 
 
89 aa  179  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  67.11 
 
 
92 aa  117  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  76.06 
 
 
105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  71.05 
 
 
107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  71.23 
 
 
76 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  61.04 
 
 
107 aa  103  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  70.15 
 
 
69 aa  103  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39780  conserved hypothetical protein TIGR00278  58 
 
 
100 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000230088  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  65.71 
 
 
132 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  66.22 
 
 
110 aa  102  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  70.42 
 
 
76 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5094  protein of unknown function DUF37  70.15 
 
 
93 aa  101  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  70.42 
 
 
76 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  60 
 
 
75 aa  101  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  56.58 
 
 
78 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  56.58 
 
 
78 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  56.58 
 
 
78 aa  100  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  56.58 
 
 
78 aa  100  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  55.26 
 
 
78 aa  100  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  55.26 
 
 
78 aa  100  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  55.26 
 
 
78 aa  100  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  55.26 
 
 
78 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  55.26 
 
 
78 aa  100  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  53.95 
 
 
78 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  67.16 
 
 
84 aa  99  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  55.26 
 
 
136 aa  97.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  62.32 
 
 
91 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  58.57 
 
 
77 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  62.67 
 
 
91 aa  95.5  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  62.32 
 
 
87 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  62.16 
 
 
85 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  62.16 
 
 
85 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  62.16 
 
 
85 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  62.16 
 
 
85 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  61.76 
 
 
81 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  57.53 
 
 
86 aa  94.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  64.18 
 
 
74 aa  94.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  62.16 
 
 
85 aa  94.4  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  63.01 
 
 
95 aa  94.4  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  63.08 
 
 
80 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  67.69 
 
 
107 aa  94  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2948  protein of unknown function DUF37  61.43 
 
 
72 aa  93.6  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000335775  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  56.34 
 
 
81 aa  93.6  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  57.53 
 
 
75 aa  93.2  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  58.57 
 
 
82 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  59.42 
 
 
75 aa  92.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  58.21 
 
 
81 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13957  hypothetical protein  57.75 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  58.21 
 
 
81 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  56.58 
 
 
86 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  55.26 
 
 
99 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  60.61 
 
 
69 aa  90.9  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  60.94 
 
 
84 aa  90.9  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0003  hypothetical protein  63.08 
 
 
85 aa  90.5  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000613833  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  60.87 
 
 
98 aa  90.5  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  55.26 
 
 
85 aa  90.1  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  52.86 
 
 
130 aa  90.1  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5413  protein of unknown function DUF37  60.29 
 
 
144 aa  90.1  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  58.21 
 
 
81 aa  89.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  60.94 
 
 
84 aa  89.4  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  62.5 
 
 
84 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  60.29 
 
 
86 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  58.21 
 
 
81 aa  89.7  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4930  hypothetical protein  62.5 
 
 
85 aa  89.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000391047  unclonable  0.00000000644601 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  56.72 
 
 
71 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  57.35 
 
 
81 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  52.78 
 
 
91 aa  89.4  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  57.53 
 
 
88 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6076  hypothetical protein  53.75 
 
 
115 aa  89  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0967401  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  54.17 
 
 
73 aa  89  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5787  hypothetical protein  51.28 
 
 
108 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.702755  normal  0.0165657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  57.97 
 
 
75 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5411  hypothetical protein  51.28 
 
 
108 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  53.52 
 
 
86 aa  89  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  62.69 
 
 
74 aa  89  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0006  hypothetical protein  51.28 
 
 
108 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814058  normal  0.0634451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  57.35 
 
 
81 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  60.94 
 
 
84 aa  87.8  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  60.94 
 
 
84 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  60.94 
 
 
84 aa  87.8  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  60.94 
 
 
84 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  60.94 
 
 
84 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  60.94 
 
 
84 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  60.94 
 
 
84 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  60.94 
 
 
84 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  60.94 
 
 
84 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  52.56 
 
 
84 aa  87.8  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0830  hypothetical protein  58.57 
 
 
115 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.854673 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  57.14 
 
 
82 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27020  conserved hypothetical protein TIGR00278  67.24 
 
 
105 aa  87  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  59.38 
 
 
84 aa  87  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  54.41 
 
 
214 aa  86.7  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  54.41 
 
 
206 aa  86.7  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  58.46 
 
 
81 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4591  hypothetical protein  63.64 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00100327  hitchhiker  0.000364901 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  56.52 
 
 
72 aa  86.3  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  53.85 
 
 
85 aa  86.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  56.72 
 
 
117 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>