More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7092 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  100 
 
 		 331 aa  652    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  70.61 
 
 		 328 aa  443  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  64.99 
 
 		 344 aa  403  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  66.77 
 
 		 334 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  67.7 
 
 		 330 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  67.7 
 
 		 330 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  66.67 
 
 		 331 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  67.7 
 
 		 330 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  64.12 
 
 		 341 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  60.05 
 
 		 391 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  59.07 
 
 		 377 aa  359  4e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  61.8 
 
 		 312 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  58.9 
 
 		 323 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  63.09 
 
 		 335 aa  352  7e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  59.58 
 
 		 333 aa  351  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  62.91 
 
 		 329 aa  348  6e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5089  parB-like partition protein  61.29 
 
 		 347 aa  347  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  60.44 
 
 		 318 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  67.68 
 
 		 309 aa  338  7e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  58.77 
 
 		 324 aa  338  8e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  58.31 
 
 		 321 aa  333  3e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  56.41 
 
 		 358 aa  328  8e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  59.06 
 
 		 529 aa  325  8.000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  51.92 
 
 		 379 aa  324  1e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  58.31 
 
 		 472 aa  322  4e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  64.31 
 
 		 392 aa  322  5e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  60.36 
 
 		 295 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3719  parB-like partition protein  64.68 
 
 		 383 aa  312  4.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118734  hitchhiker  0.00185127 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  50.95 
 
 		 367 aa  310  2e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4506  parB-like partition protein  59.06 
 
 		 410 aa  299  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  55.31 
 
 		 314 aa  296  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  61.66 
 
 		 268 aa  292  7e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1443  putative transcriptional regulator  50.66 
 
 		 424 aa  289  4e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3930  parB-like partition protein  62.32 
 
 		 438 aa  286  5e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000021356 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4165  chromosome segregation DNA-binding protein  58.04 
 
 		 394 aa  280  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.308582  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31910  ParB-like partition protein  56.13 
 
 		 624 aa  270  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9049  parB-like partition protein  45.8 
 
 		 398 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740864  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0053  ParB-like protein  50.18 
 
 		 450 aa  258  9e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  43.81 
 
 		 306 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  42.9 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  39.43 
 
 		 295 aa  210  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  41.8 
 
 		 290 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  42.91 
 
 		 279 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  37.66 
 
 		 286 aa  209  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  37.66 
 
 		 286 aa  209  7e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  40.32 
 
 		 307 aa  207  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  37.93 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  40.69 
 
 		 282 aa  206  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  42.54 
 
 		 279 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  42.31 
 
 		 290 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  42.31 
 
 		 290 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  38.24 
 
 		 286 aa  205  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  42.08 
 
 		 285 aa  205  9e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  37.46 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  43.09 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  42.24 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  42.49 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  43.09 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  43.77 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  41.79 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  40.95 
 
 		 290 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  43.33 
 
 		 293 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  38.94 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  42.7 
 
 		 283 aa  202  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  39.75 
 
 		 304 aa  202  7e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  37.3 
 
 		 306 aa  202  7e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  41.67 
 
 		 293 aa  202  9e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  42.34 
 
 		 278 aa  202  9e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  41.67 
 
 		 293 aa  202  9e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  41.8 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  41.8 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  42.75 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  42.75 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  41.8 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  41.8 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  41.8 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  39.18 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  41.8 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  41.8 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  42.8 
 
 		 283 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  36.28 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  42.59 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  43.63 
 
 		 283 aa  199  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  41.16 
 
 		 295 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  43.02 
 
 		 283 aa  198  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  42.37 
 
 		 283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  42.64 
 
 		 256 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  37.38 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  43.38 
 
 		 319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  43.27 
 
 		 292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  40.31 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  36.54 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  42.75 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  42.75 
 
 		 293 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  50.53 
 
 		 287 aa  195  9e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  42.35 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  39.81 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  42.25 
 
 		 256 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  43.18 
 
 		 283 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  38.61 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>