More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7045 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_7045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
250 aa  489  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.44 
 
 
281 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.23 
 
 
250 aa  195  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.991261  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
255 aa  192  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
269 aa  188  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 
252 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
263 aa  172  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
255 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.76 
 
 
263 aa  170  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
256 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
253 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.024976  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
255 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00276657  normal  0.102342 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 
249 aa  168  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  37.2 
 
 
256 aa  169  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
248 aa  168  8e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
282 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
251 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 
247 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.585241  normal  0.0114993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2283  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  45.04 
 
 
251 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.890359 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 
255 aa  166  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.7 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
251 aa  162  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.3 
 
 
246 aa  163  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 
252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
260 aa  161  8.000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  39.43 
 
 
251 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
252 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
254 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 
260 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
250 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
254 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
254 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
252 aa  159  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
256 aa  159  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.26 
 
 
246 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
258 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
244 aa  159  5e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
244 aa  158  7e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
254 aa  158  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
257 aa  158  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
270 aa  158  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17920  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  41.15 
 
 
251 aa  158  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.355358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
250 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
254 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
255 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.233538  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
255 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  40.64 
 
 
253 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.45 
 
 
254 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.43 
 
 
247 aa  156  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
257 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.51 
 
 
249 aa  156  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
256 aa  155  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.31 
 
 
246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.94 
 
 
250 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
256 aa  155  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  37.94 
 
 
250 aa  155  7e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.52 
 
 
249 aa  154  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1946  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.01 
 
 
262 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
274 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
282 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  39.44 
 
 
253 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.9 
 
 
247 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
245 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.96 
 
 
246 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
258 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
267 aa  153  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.092297  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
276 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  38.31 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
250 aa  152  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
260 aa  152  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0264  putative short-chain dehydrogenase  39.83 
 
 
262 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
282 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.43 
 
 
246 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
282 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
251 aa  152  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.677514  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  36.55 
 
 
257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.18 
 
 
246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 
321 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00780913  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
267 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
262 aa  151  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 
253 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 
246 aa  151  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 
251 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
258 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7132  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
257 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.928828  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
250 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
254 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 
247 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203668  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 
257 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2281  short chain dehydrogenase  36.63 
 
 
257 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2588  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.87 
 
 
248 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  37.96 
 
 
253 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
251 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
253 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
251 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.83 
 
 
262 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
260 aa  149  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000468902  normal  0.0104317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>