More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7042 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  100 
 
 		 151 aa  292  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  67.11 
 
 		 152 aa  211  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  63.51 
 
 		 151 aa  186  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  61.9 
 
 		 148 aa  185  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  62.16 
 
 		 152 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  62.67 
 
 		 150 aa  182  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  59.86 
 
 		 148 aa  181  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  61.22 
 
 		 149 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  62.16 
 
 		 151 aa  180  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  62.84 
 
 		 152 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  62.84 
 
 		 152 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  62.84 
 
 		 152 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  56.67 
 
 		 151 aa  176  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  62.42 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  59.86 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  57.82 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  60.81 
 
 		 150 aa  169  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  59.73 
 
 		 148 aa  168  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  55.7 
 
 		 148 aa  166  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  58.28 
 
 		 148 aa  165  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  55.1 
 
 		 149 aa  164  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  53.06 
 
 		 148 aa  161  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  56.16 
 
 		 151 aa  158  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  55.78 
 
 		 150 aa  155  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  59.18 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  53.42 
 
 		 149 aa  154  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  57.14 
 
 		 148 aa  153  8e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  50.34 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  50 
 
 		 149 aa  140  8e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  52.05 
 
 		 151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  53.38 
 
 		 151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  47.26 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  47.26 
 
 		 150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  47.95 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  43.84 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  43.05 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  47.26 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  45.21 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 147 aa  110  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 148 aa  110  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  47.3 
 
 		 146 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  42.11 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  43.62 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  44.9 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  44.3 
 
 		 151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  41.18 
 
 		 151 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  39.33 
 
 		 151 aa  106  9.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  36 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  42.95 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3480  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.34024  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 147 aa  103  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 147 aa  103  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  38.56 
 
 		 151 aa  103  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  40.4 
 
 		 152 aa  103  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 159 aa  102  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5596  50S ribosomal protein L9  42.95 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  43.07 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 170 aa  101  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  39.22 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1668  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 175 aa  101  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.197637  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2852  50S ribosomal protein L9  35.57 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3244  50S ribosomal protein L9  35.1 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  39.33 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5322  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5150  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000483517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5166  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0461945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5718  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000626689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5579  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17506e-22 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 		 179 aa  99.8  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  34 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5339  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000103383  hitchhiker  0.00000000147927 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  38.82 
 
 		 178 aa  99.8  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  40.56 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  41.5 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 167 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  35.81 
 
 		 179 aa  99  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 151 aa  98.6  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 194 aa  98.6  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  36.42 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1216  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 148 aa  97.8  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  39.47 
 
 		 149 aa  97.4  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 149 aa  97.1  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2193  50S ribosomal protein L9  39.33 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0287  ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0120134  normal  0.0123082 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 209 aa  95.9  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>