More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7034 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7034  glycosyl transferase family 51  100 
 
 		 838 aa  1719    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39340  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  43.3 
 
 		 814 aa  557  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.794703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  41.5 
 
 		 806 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  41.5 
 
 		 806 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  41.5 
 
 		 806 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  41.28 
 
 		 821 aa  431  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0871  glycosyl transferase family protein  41.33 
 
 		 815 aa  428  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6036  glycosyl transferase family protein  40.96 
 
 		 830 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852412  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4192  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.52 
 
 		 950 aa  398  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495608  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.63 
 
 		 725 aa  372  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4745  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.73 
 
 		 769 aa  342  1e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.78 
 
 		 1129 aa  323  9.000000000000001e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 		 695 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  33.48 
 
 		 719 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  34.6 
 
 		 975 aa  303  7.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  34.19 
 
 		 1117 aa  303  8.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4845  glycosyl transferase family 51  31.94 
 
 		 978 aa  300  9e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  33.87 
 
 		 979 aa  298  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.38 
 
 		 890 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  33.44 
 
 		 836 aa  285  3.0000000000000004e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.7 
 
 		 764 aa  282  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  33.39 
 
 		 1306 aa  278  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  32.25 
 
 		 1245 aa  275  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  34.82 
 
 		 764 aa  275  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 		 778 aa  274  6e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  32.62 
 
 		 961 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5918  glycosyl transferase family 51  29.78 
 
 		 927 aa  265  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 		 1065 aa  265  4e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  31.4 
 
 		 822 aa  264  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.29 
 
 		 747 aa  264  4.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.21 
 
 		 859 aa  259  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  31.73 
 
 		 724 aa  258  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1278  membrane carboxypeptidase  30.8 
 
 		 727 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  30.28 
 
 		 808 aa  253  8.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  31.23 
 
 		 825 aa  250  9e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  31.98 
 
 		 704 aa  248  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5193  glycosyl transferase family 51  31.38 
 
 		 752 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  30.62 
 
 		 761 aa  245  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  30.61 
 
 		 803 aa  240  6.999999999999999e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  31.09 
 
 		 774 aa  236  9e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3566  peptidoglycan glycosyltransferase  29.12 
 
 		 867 aa  230  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.71222 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  29.24 
 
 		 905 aa  221  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  30.36 
 
 		 761 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  29.65 
 
 		 880 aa  220  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  29.62 
 
 		 819 aa  217  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  29.88 
 
 		 784 aa  216  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  27.82 
 
 		 661 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  30.1 
 
 		 817 aa  213  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  28.99 
 
 		 648 aa  210  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  29.73 
 
 		 765 aa  208  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  28.23 
 
 		 727 aa  208  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  29.56 
 
 		 779 aa  207  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  29.7 
 
 		 776 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  30.64 
 
 		 643 aa  205  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  31.27 
 
 		 763 aa  205  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  29.12 
 
 		 880 aa  205  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  30.64 
 
 		 643 aa  205  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  30.93 
 
 		 730 aa  205  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  29.49 
 
 		 646 aa  204  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  27.9 
 
 		 712 aa  204  7e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  27.07 
 
 		 683 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2691  glycosyl transferase family 51  29.36 
 
 		 711 aa  201  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0728241 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  28.07 
 
 		 683 aa  201  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  30.72 
 
 		 770 aa  201  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  28.26 
 
 		 681 aa  200  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  28.12 
 
 		 683 aa  201  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  27.24 
 
 		 683 aa  200  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  28.12 
 
 		 683 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  28.72 
 
 		 829 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  27.08 
 
 		 683 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  29.42 
 
 		 833 aa  200  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  29.67 
 
 		 714 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  29.33 
 
 		 727 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  27.08 
 
 		 683 aa  198  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  29.35 
 
 		 640 aa  198  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  27.52 
 
 		 811 aa  199  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  27.74 
 
 		 649 aa  198  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  26.75 
 
 		 806 aa  198  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  27.93 
 
 		 776 aa  198  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  26.92 
 
 		 683 aa  197  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  28.19 
 
 		 732 aa  197  7e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  26.92 
 
 		 683 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  27.41 
 
 		 683 aa  196  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  26.92 
 
 		 683 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  28.44 
 
 		 744 aa  196  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  29.34 
 
 		 727 aa  196  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  28.57 
 
 		 701 aa  195  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  31.19 
 
 		 723 aa  195  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 		 820 aa  194  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  29.34 
 
 		 727 aa  194  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  30.99 
 
 		 643 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  29.77 
 
 		 722 aa  194  5e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  29.94 
 
 		 714 aa  194  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  27.2 
 
 		 795 aa  193  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  28.59 
 
 		 734 aa  192  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  27.91 
 
 		 668 aa  192  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  29.33 
 
 		 750 aa  191  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  27.64 
 
 		 735 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  29.69 
 
 		 821 aa  191  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  31.06 
 
 		 656 aa  191  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.129187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>