290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7032 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 181 aa  352  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  77.71 
 
 		 184 aa  242  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  71.19 
 
 		 181 aa  224  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  65.56 
 
 		 224 aa  224  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  70.06 
 
 		 181 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  63.48 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  70.69 
 
 		 180 aa  216  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  65.32 
 
 		 213 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  67.78 
 
 		 252 aa  211  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  60.69 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  60 
 
 		 229 aa  204  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  60.56 
 
 		 205 aa  200  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  68.82 
 
 		 181 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  68.82 
 
 		 181 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  68.82 
 
 		 181 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  61.75 
 
 		 249 aa  192  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  57.14 
 
 		 227 aa  189  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  57.23 
 
 		 212 aa  187  9e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  58.64 
 
 		 199 aa  186  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  63.89 
 
 		 212 aa  184  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  63.69 
 
 		 211 aa  184  8e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  62.07 
 
 		 272 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  54.02 
 
 		 202 aa  181  5.0000000000000004e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  51.56 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  63.48 
 
 		 198 aa  178  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  63.79 
 
 		 199 aa  177  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  51.4 
 
 		 203 aa  175  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  53.41 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  52.02 
 
 		 187 aa  155  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  48.19 
 
 		 198 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  30.9 
 
 		 191 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  37.5 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  34.43 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  32.04 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0038  transcriptional regulator, PadR-like family  38.78 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  26.04 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  25.44 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  43.21 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  32.93 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  24.85 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  24.26 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  24.26 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  24.26 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  24.26 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  24.26 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  31.79 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  35.42 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  36.46 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  41.76 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  36.89 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  32.93 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  34.34 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  29.52 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  30 
 
 		 168 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  37.84 
 
 		 114 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  44.44 
 
 		 226 aa  52.4  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  34.51 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  30.18 
 
 		 175 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  32.48 
 
 		 111 aa  52.4  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  39.24 
 
 		 107 aa  51.6  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  35 
 
 		 152 aa  51.6  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1958  transcriptional regulator, PadR-like family  36.56 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 372 aa  50.8  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  27.74 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  30.05 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  30.49 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  30.94 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  36.17 
 
 		 112 aa  49.7  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 118 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  32.35 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  40.96 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  40.96 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  30.49 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 118 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1562  transcriptional regulator, PadR-like family  37.78 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 118 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  30.05 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  37.21 
 
 		 121 aa  49.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  25 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  37.93 
 
 		 183 aa  49.3  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  37.04 
 
 		 116 aa  48.9  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  27.66 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 242 aa  48.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  30.23 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>