More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7030 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_7030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
242 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.26 
 
 
265 aa  296  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.66 
 
 
267 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
286 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000174886  normal  0.399546 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
253 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
262 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
271 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
262 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
263 aa  159  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 
257 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
262 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
255 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0755029  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.76 
 
 
250 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.76 
 
 
250 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.96 
 
 
246 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 
275 aa  153  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.27 
 
 
247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
260 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
248 aa  152  7e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
257 aa  152  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
261 aa  151  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
255 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271838  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7123  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 
249 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2375  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
265 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
267 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.239754  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3027  Short-chain dehydrogenase/reductase  41.11 
 
 
259 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.730472  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
262 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  40.82 
 
 
249 aa  149  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
283 aa  149  3e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419965  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0620  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.13 
 
 
250 aa  148  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.890979 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.644863  normal  0.553808 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  38.62 
 
 
254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2462  short chain dehydrogenase  40 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.65 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 
262 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
251 aa  146  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00521448  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2818  short chain dehydrogenase  41.39 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2791  short chain dehydrogenase  41.39 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2835  short chain dehydrogenase  41.39 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.34 
 
 
250 aa  144  9e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1779  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, putative  36.43 
 
 
263 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
251 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
254 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
255 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00276657  normal  0.102342 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
255 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3420  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 
256 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0769277  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0950  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 
256 aa  143  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.477872  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3287  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 
256 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
256 aa  143  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
267 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  38.58 
 
 
259 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  35.34 
 
 
250 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.55 
 
 
266 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2421  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
259 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 
270 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0156103  normal  0.420839 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0240  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.84 
 
 
261 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.67492  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
260 aa  143  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  38.52 
 
 
260 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
256 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4826  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
244 aa  142  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.806753 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1976  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.51 
 
 
261 aa  142  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3207  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.25 
 
 
246 aa  142  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.819769  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
251 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000195486  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  41.46 
 
 
255 aa  142  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 
255 aa  141  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.815314 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
254 aa  141  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
253 aa  141  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20330  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
281 aa  141  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
248 aa  141  9e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2355  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.35 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7112  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
248 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.912642 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
251 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.11 
 
 
249 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2389  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.5 
 
 
255 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2043  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
251 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2343  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.73 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1607  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.45 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000319104  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  38.43 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.11 
 
 
251 aa  139  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
252 aa  139  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.1 
 
 
245 aa  139  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
262 aa  139  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
250 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
253 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.044107  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.32 
 
 
274 aa  139  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
254 aa  139  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0694225  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00771979  normal  0.364643 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0197  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.62 
 
 
245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>