More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7008 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  100 
 
 
402 aa  777    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  45.3 
 
 
420 aa  250  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  50.49 
 
 
410 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  45.07 
 
 
408 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  36.67 
 
 
439 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  45.9 
 
 
417 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  43.3 
 
 
423 aa  215  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  40.96 
 
 
447 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.77 
 
 
394 aa  212  7.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 
445 aa  209  9e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  42.29 
 
 
405 aa  208  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  39.39 
 
 
422 aa  207  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 
441 aa  207  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  45.71 
 
 
407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  39.6 
 
 
395 aa  201  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 
420 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  46 
 
 
397 aa  194  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  45.19 
 
 
384 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  41.08 
 
 
399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  42.35 
 
 
372 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 
398 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  47.94 
 
 
367 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 
439 aa  186  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  48.03 
 
 
428 aa  186  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  35.85 
 
 
400 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  48.77 
 
 
443 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  38.16 
 
 
433 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  44.58 
 
 
442 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  39.94 
 
 
372 aa  180  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  43.82 
 
 
384 aa  177  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  43.15 
 
 
478 aa  176  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  41.92 
 
 
421 aa  176  9e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
441 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  43.25 
 
 
399 aa  170  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  50.71 
 
 
388 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  50.23 
 
 
392 aa  169  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.43 
 
 
370 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2450  histidine kinase  39.53 
 
 
432 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.516192  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.41 
 
 
406 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  50 
 
 
408 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4052  histidine kinase  47.66 
 
 
385 aa  164  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.71 
 
 
378 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  42.97 
 
 
430 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  36.07 
 
 
443 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  44.92 
 
 
369 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  36.02 
 
 
438 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 
405 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 
394 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.53 
 
 
386 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 
424 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.94 
 
 
424 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  43.46 
 
 
406 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  45.06 
 
 
372 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  34.25 
 
 
392 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.94 
 
 
470 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  46.84 
 
 
394 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 
403 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  47.06 
 
 
430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 
382 aa  153  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0292279  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0607  histidine kinase  41.06 
 
 
434 aa  153  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
503 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  45.26 
 
 
380 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  34.72 
 
 
402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  34.38 
 
 
384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.09 
 
 
438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 
469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  43.72 
 
 
442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  44.1 
 
 
470 aa  145  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.13 
 
 
430 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1620  histidine kinase  38.29 
 
 
380 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.53 
 
 
400 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  38.79 
 
 
357 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  49.28 
 
 
383 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6695  two component LuxR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
398 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04490  signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
469 aa  145  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  40.3 
 
 
395 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
404 aa  144  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  41.59 
 
 
375 aa  143  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  35.53 
 
 
380 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4135  putative signal transduction histidine kinase  45.87 
 
 
444 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  46.38 
 
 
457 aa  142  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 
360 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.109837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  33.5 
 
 
414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 
416 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4469  putative two-component system sensor kinase  33.33 
 
 
384 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
421 aa  140  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  34.8 
 
 
380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 
392 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  32.35 
 
 
462 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
496 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
391 aa  139  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7811  histidine kinase  39.77 
 
 
291 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2459  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.21 
 
 
384 aa  139  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134403  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.84 
 
 
524 aa  139  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00577691  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  36.09 
 
 
408 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
500 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03530  signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 
484 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 
444 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  38.77 
 
 
428 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  43.38 
 
 
387 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>