23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6990 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6990  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  547  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0692886  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7214  hypothetical protein  39.57 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.906304 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0492  hypothetical protein  31.72 
 
 
347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0964  hypothetical protein  36.31 
 
 
231 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0063713  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8334  hypothetical protein  32.26 
 
 
308 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0824373  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4877  AAA ATPase  39.74 
 
 
856 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1230  hypothetical protein  31.02 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1607  hypothetical protein  30.11 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927317  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  32.62 
 
 
524 aa  72.4  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6886  hypothetical protein  31.58 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1992  hypothetical protein  34.09 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000239593  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26890  hypothetical protein  33.53 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.66835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1332  hypothetical protein  35 
 
 
751 aa  62.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0324065  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4519  hypothetical protein  27.71 
 
 
239 aa  62  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  31.9 
 
 
464 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4575  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 
513 aa  59.3  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2682  hypothetical protein  32.79 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0583833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3720  hypothetical protein  31.29 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0633  hypothetical protein  30.46 
 
 
209 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5510  hypothetical protein  31.33 
 
 
205 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242777  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0398  hypothetical protein  25.15 
 
 
351 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1166  hypothetical protein  29.24 
 
 
227 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137504  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5505  hypothetical protein  37.88 
 
 
241 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337015  normal  0.270738 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>