More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6953 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3407  hypothetical protein  49.46 
 
 		 699 aa  704    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0261  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  54.23 
 
 		 748 aa  770    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  53.26 
 
 		 716 aa  781    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0071  hypothetical protein  52.19 
 
 		 727 aa  768    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0465  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  66.71 
 
 		 1131 aa  977    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5262  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  62.26 
 
 		 737 aa  911    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0429  hypothetical protein  51.39 
 
 		 1042 aa  725    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.811487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0054  hypothetical protein  57.14 
 
 		 732 aa  830    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0451564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38640  Fe-S oxidoreductase  79.14 
 
 		 762 aa  1234    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4350  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  47.62 
 
 		 743 aa  640    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  51.4 
 
 		 737 aa  749    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4337  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  63.31 
 
 		 1215 aa  997    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0442  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  51.39 
 
 		 1046 aa  724    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.14 
 
 		 717 aa  700    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0059  hypothetical protein  58.41 
 
 		 718 aa  835    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0278  hypothetical protein  51.95 
 
 		 1044 aa  718    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 		 758 aa  1553    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10343  iron-sulfur-binding reductase  53.01 
 
 		 882 aa  709    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.557854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4809  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  59.18 
 
 		 762 aa  877    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0238  hypothetical protein  47.77 
 
 		 739 aa  647    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855121  normal  0.712535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4404  hypothetical protein  48.87 
 
 		 1033 aa  649    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326408  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26190  Fe-S oxidoreductase  50.97 
 
 		 1388 aa  718    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0452  hypothetical protein  51.39 
 
 		 1046 aa  724    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.506631  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0619  hypothetical protein  52.17 
 
 		 1027 aa  711    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321206  normal  0.108108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9137  hypothetical protein  49.29 
 
 		 716 aa  663    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  48.62 
 
 		 721 aa  637    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0207  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.5 
 
 		 774 aa  628  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.987392 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2113  hypothetical protein  44.1 
 
 		 683 aa  527  1e-148  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.177792 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.39 
 
 		 676 aa  514  1e-144  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0008  hypothetical protein  38.37 
 
 		 711 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.96 
 
 		 722 aa  418  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.96 
 
 		 711 aa  416  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.787604  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3345  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.74 
 
 		 699 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000110964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.95 
 
 		 711 aa  412  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0009  hypothetical protein  38.97 
 
 		 678 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.43 
 
 		 686 aa  408  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  35.92 
 
 		 727 aa  402  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.81 
 
 		 694 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  36.05 
 
 		 730 aa  399  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.51 
 
 		 698 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5143  hypothetical protein  34.12 
 
 		 703 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1213  hypothetical protein  35.74 
 
 		 661 aa  395  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5468  ferredoxin, 4Fe-4S  33.82 
 
 		 703 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000379951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5476  ferredoxin, 4Fe-4S  33.86 
 
 		 703 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5194  ferredoxin, 4Fe-4S  33.64 
 
 		 703 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0190376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5029  ferredoxin, 4Fe-4S  33.64 
 
 		 703 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5045  ferredoxin, 4Fe-4S  33.64 
 
 		 703 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5590  ferredoxin, 4Fe-4S  33.64 
 
 		 703 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5523  ferredoxin, 4Fe-4S  33.86 
 
 		 703 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2367  hypothetical protein  36.14 
 
 		 683 aa  394  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5438  ferredoxin, 4Fe-4S  33.64 
 
 		 703 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0164712 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0685  hypothetical protein  34.71 
 
 		 659 aa  392  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808103  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  34.67 
 
 		 678 aa  392  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3866  hypothetical protein  33.24 
 
 		 703 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00245399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2414  hypothetical protein  34.98 
 
 		 652 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3646  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35 
 
 		 694 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.29 
 
 		 699 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  35.39 
 
 		 629 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3765  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.16 
 
 		 712 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0441363  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.15 
 
 		 683 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0570  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.32 
 
 		 655 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0837064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2795  iron-sulfur cluster-binding protein  33.1 
 
 		 661 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.623048  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2426  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.46 
 
 		 679 aa  377  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2087  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.56 
 
 		 663 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.371437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2255  hypothetical protein  34.76 
 
 		 655 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000010012  hitchhiker  0.0000000000013579 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  34.73 
 
 		 658 aa  372  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  40.64 
 
 		 752 aa  371  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000771252  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0698  putative iron-sulfur-binding reductase  33.29 
 
 		 714 aa  370  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0314835  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.42 
 
 		 656 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2925  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.96 
 
 		 658 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.85 
 
 		 713 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1359  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.96 
 
 		 658 aa  365  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.548906  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.34 
 
 		 656 aa  364  4e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.63 
 
 		 664 aa  364  4e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2131  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.24 
 
 		 663 aa  360  4e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1502  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.92 
 
 		 664 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0874  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  34.39 
 
 		 989 aa  349  9e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  normal  0.996162 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3229  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.37 
 
 		 661 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1035  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.22 
 
 		 661 aa  319  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2791  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.62 
 
 		 662 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589243 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1463  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.22 
 
 		 662 aa  317  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1714  hypothetical protein  29.59 
 
 		 671 aa  317  7e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2070  hypothetical protein  38.23 
 
 		 663 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2264  hypothetical protein  30.48 
 
 		 661 aa  311  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.968326  hitchhiker  0.00000860072 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2831  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.69 
 
 		 714 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1382  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.69 
 
 		 722 aa  307  6e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3039  hypothetical protein  29.49 
 
 		 661 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1600  hypothetical protein  35.73 
 
 		 661 aa  299  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1417  hypothetical protein  29.76 
 
 		 688 aa  297  5e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1527  hypothetical protein  37.76 
 
 		 654 aa  295  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1708  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.16 
 
 		 641 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3399  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.66 
 
 		 629 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.58436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2267  hypothetical protein  29.86 
 
 		 692 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00913496  hitchhiker  0.0000724137 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0754  hypothetical protein  34.55 
 
 		 643 aa  278  2e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.39993 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5959  hypothetical protein  30.33 
 
 		 720 aa  277  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0717248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0461  hypothetical protein  33.68 
 
 		 703 aa  277  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.667458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0746  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.37 
 
 		 266 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0332  hypothetical protein  34.66 
 
 		 650 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0251968  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0494  hypothetical protein  35.58 
 
 		 653 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0311  iron-sulfur cluster-binding protein  34.66 
 
 		 650 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0857951  hitchhiker  0.00322201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>