More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6948 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  100 
 
 		 217 aa  427  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  52.5 
 
 		 218 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  54.09 
 
 		 261 aa  178  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  50.98 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  50.8 
 
 		 193 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  52.35 
 
 		 298 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  56.76 
 
 		 193 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  52.6 
 
 		 271 aa  159  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  57.25 
 
 		 299 aa  155  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  47.78 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  46.99 
 
 		 240 aa  150  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  55.8 
 
 		 265 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  46.27 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  51.75 
 
 		 232 aa  148  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  47.5 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  48 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  48 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  53.52 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  44.12 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  48.57 
 
 		 267 aa  139  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  43.81 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  44.02 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  45.83 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  48.94 
 
 		 278 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  53.66 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  54.2 
 
 		 199 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  46.07 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  43.43 
 
 		 264 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  39.34 
 
 		 224 aa  121  8e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  45.11 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  52.21 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  43.17 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  36.13 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  38.46 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  36.13 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  38.54 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  34.76 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  43.09 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  36.65 
 
 		 201 aa  99.8  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  37.04 
 
 		 206 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  39.26 
 
 		 207 aa  94.7  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  33.14 
 
 		 226 aa  94.7  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  39.23 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  40.26 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  37.33 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  35.03 
 
 		 248 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  36.71 
 
 		 172 aa  93.6  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  41.86 
 
 		 194 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  36.71 
 
 		 172 aa  92.8  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  39.69 
 
 		 189 aa  92.4  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  27.96 
 
 		 187 aa  92  6e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  35.15 
 
 		 282 aa  90.5  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  36.67 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  33.57 
 
 		 192 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  39.08 
 
 		 208 aa  89  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  36.41 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  33.57 
 
 		 192 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  35.92 
 
 		 246 aa  88.6  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2165  GrpE protein  36.49 
 
 		 191 aa  88.2  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.281053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  35.21 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  34.04 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  38.17 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  33.57 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  40.77 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  33.12 
 
 		 188 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  35.62 
 
 		 286 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  33.12 
 
 		 188 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  33.57 
 
 		 198 aa  86.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  30 
 
 		 210 aa  85.9  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  34.38 
 
 		 192 aa  85.5  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  39.06 
 
 		 194 aa  85.5  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00660  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  39.23 
 
 		 248 aa  85.5  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.204562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  34.16 
 
 		 181 aa  85.1  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  35.42 
 
 		 213 aa  85.1  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  32.5 
 
 		 188 aa  84.7  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  32.5 
 
 		 188 aa  84.7  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  32.5 
 
 		 188 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  32.5 
 
 		 188 aa  84.7  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  32.5 
 
 		 188 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  33.33 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  31.13 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  32.37 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  30.21 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  34.25 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  35 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  35.33 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  33.53 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  34.25 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  35.71 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  36 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  34.04 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  32.62 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  36.81 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  33.77 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  33.82 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  33.82 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  34.71 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4434  GrpE protein  38.64 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>