245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6832 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 		 200 aa  377  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  51.96 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  48 
 
 		 541 aa  171  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  49.49 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  44.88 
 
 		 534 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  50.25 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  48.74 
 
 		 539 aa  167  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  45.73 
 
 		 553 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  46.78 
 
 		 248 aa  166  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  50.99 
 
 		 204 aa  165  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  49.28 
 
 		 235 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0377  allophanate hydrolase subunit 1  49.51 
 
 		 233 aa  164  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0129741 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  46.57 
 
 		 562 aa  164  9e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  50.25 
 
 		 518 aa  163  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  48.5 
 
 		 531 aa  163  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00390  allophanate hydrolase subunit 1  49.75 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  45.81 
 
 		 539 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  49.26 
 
 		 203 aa  160  9e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  44.5 
 
 		 549 aa  160  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  47.29 
 
 		 209 aa  157  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  45.77 
 
 		 555 aa  157  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  46.23 
 
 		 536 aa  156  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4801  Allophanate hydrolase subunit 1  47.5 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.440705 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  47.32 
 
 		 522 aa  156  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  50.75 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0268  allophanate hydrolase subunit 1  48 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0278  allophanate hydrolase subunit 1  48 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0258  allophanate hydrolase subunit 1  48 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.161763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2977  allophanate hydrolase subunit 1  47.76 
 
 		 203 aa  152  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358004  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1378  Allophanate hydrolase subunit 1  55.68 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.239875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  47.39 
 
 		 564 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0593  allophanate hydrolase subunit 1  47.42 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0362915  normal  0.623241 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  45.32 
 
 		 539 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  53.96 
 
 		 571 aa  143  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  48.89 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  42.38 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  42.38 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  44.66 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  42.38 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  42.38 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  42.38 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  42.38 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  42.38 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  42.38 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  42.38 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  41.9 
 
 		 218 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  41.9 
 
 		 218 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  41.9 
 
 		 218 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  41.9 
 
 		 218 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  41.43 
 
 		 218 aa  138  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  48.26 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2790  Allophanate hydrolase subunit 1  55.97 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  42.38 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0008  allophanate hydrolase subunit 1  45.35 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  36.36 
 
 		 221 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0097  allophanate hydrolase subunit 1  43.5 
 
 		 258 aa  135  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  44.71 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  43.06 
 
 		 253 aa  134  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  45.02 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  45.02 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  45.02 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  43.72 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  40.91 
 
 		 231 aa  131  5e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  44.94 
 
 		 219 aa  130  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0023  hypothetical protein  51.59 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1406  allophanate hydrolase subunit 1  44.51 
 
 		 234 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  44.08 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  43.98 
 
 		 230 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  32.85 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  40.48 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1801  hypothetical protein  45.81 
 
 		 205 aa  128  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  43.6 
 
 		 218 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  42.49 
 
 		 233 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  43.55 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  43.01 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  43.69 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  45.05 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  43.55 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4346  allophanate hydrolase subunit 1  40.1 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1268  Allophanate hydrolase subunit 1  47.4 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  45.05 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  46.97 
 
 		 585 aa  126  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  45.05 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  45.05 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  45.05 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1100  allophanate hydrolase subunit 1  41.14 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.724491  normal  0.149569 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  40.78 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  41.59 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  41.43 
 
 		 218 aa  124  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10268  hypothetical protein  41.12 
 
 		 217 aa  124  9e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  40.29 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  43.2 
 
 		 215 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  39.44 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  32.11 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  40.95 
 
 		 218 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  44.71 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  45.51 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  54.1 
 
 		 499 aa  122  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5815  allophanate hydrolase subunit 1  41.36 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100836  normal  0.0693408 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0360  allophanate hydrolase subunit 1  38.42 
 
 		 234 aa  121  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.120122  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>