69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6745 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6745  Proline dehydrogenase  100 
 
 		 286 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.989214  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02730  L-proline dehydrogenase  46.01 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0480  L-proline dehydrogenase  41.9 
 
 		 316 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4460  Proline dehydrogenase  46.89 
 
 		 306 aa  208  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5760  Proline dehydrogenase  40.14 
 
 		 306 aa  205  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0342  proline dehydrogenase  43.26 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0992788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1081  Proline dehydrogenase  45.65 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962352  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1511  proline dehydrogenase  40.97 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0201  Proline dehydrogenase  42.47 
 
 		 317 aa  192  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0078  Proline dehydrogenase  43.37 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0409  proline dehydrogenase  44.16 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3097  proline dehydrogenase  41.73 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.274193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8354  Proline dehydrogenase  41.22 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0248  L-proline dehydrogenase  39.8 
 
 		 317 aa  180  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24480  L-proline dehydrogenase  38.57 
 
 		 319 aa  178  8e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0434  L-proline dehydrogenase  42.24 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1424  Proline dehydrogenase  42.75 
 
 		 311 aa  169  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0568562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0646  Proline dehydrogenase  40.65 
 
 		 308 aa  168  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11212  proline dehydrogenase  38.62 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0207588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4100  L-proline dehydrogenase  35.31 
 
 		 318 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4255  L-proline dehydrogenase  35.31 
 
 		 318 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4025  L-proline dehydrogenase  35.31 
 
 		 318 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2823  L-proline dehydrogenase  43.37 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1295  Proline dehydrogenase  37.01 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4483  Proline dehydrogenase  38.41 
 
 		 306 aa  149  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4525  proline dehydrogenase  34.28 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0088  L-proline dehydrogenase  35.54 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5153  proline dehydrogenase family protein  27.3 
 
 		 305 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3090  Proline dehydrogenase  26.52 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0091  proline dehydrogenase family protein  27.3 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5121  proline dehydrogenase family protein  27.3 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5148  proline dehydrogenase family protein  27.3 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5159  proline dehydrogenase family protein  27.3 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4879  proline dehydrogenase family protein  27.3 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4721  proline dehydrogenase  27.3 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4736  proline dehydrogenase  27.3 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5253  proline dehydrogenase family protein  27.3 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0498834  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4838  proline dehydrogenase  26.6 
 
 		 305 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3600  proline dehydrogenase  26.95 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2939  Proline dehydrogenase  26.43 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2524  Proline dehydrogenase  29.82 
 
 		 307 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.30854  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0599  Proline dehydrogenase  27.5 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4054  Proline dehydrogenase  30.88 
 
 		 279 aa  108  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0662  Proline dehydrogenase  32.74 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0346  proline dehydrogenase  26.09 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2640  Proline dehydrogenase  30.71 
 
 		 307 aa  102  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3124  Proline dehydrogenase  32.86 
 
 		 307 aa  102  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2428  proline dehydrogenase  35.04 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.342567 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1338  L-proline dehydrogenase  27.08 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1150  Proline dehydrogenase  31.65 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.906847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0351  Proline dehydrogenase  29.58 
 
 		 279 aa  92.8  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0346031  normal  0.177758 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1324  proline dehydrogenase  23.16 
 
 		 333 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.26467  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2923  L-proline dehydrogenase  30.18 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0183  Proline dehydrogenase  27.76 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0851  proline dehydrogenase  29.64 
 
 		 310 aa  90.1  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.435625  normal  0.094276 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1819  proline dehydrogenase  23.27 
 
 		 333 aa  86.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1854  proline dehydrogenase  23.27 
 
 		 333 aa  86.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1107  Proline dehydrogenase  29.68 
 
 		 277 aa  85.5  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000219006  normal  0.0483795 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0949  Proline dehydrogenase  28.71 
 
 		 295 aa  85.5  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5008  proline dehydrogenase  26.16 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2929  Proline dehydrogenase  29.41 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2465  proline dehydrogenase  29.51 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1500  L-proline dehydrogenase  28.28 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49139  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0496  Proline dehydrogenase  29.86 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1366  proline dehydrogenase superfamily protein  29.85 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3332  proline dehydrogenase  28.57 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  24 
 
 		 996 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  21.21 
 
 		 1001 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0054  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  22.69 
 
 		 1003 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>