More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6730 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 438 aa  848    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  61.73 
 
 		 443 aa  511  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  57.79 
 
 		 445 aa  451  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  56.06 
 
 		 468 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  56.52 
 
 		 447 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  56.52 
 
 		 447 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  56.52 
 
 		 447 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  54.73 
 
 		 455 aa  425  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  56.12 
 
 		 456 aa  428  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  55.66 
 
 		 457 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  53 
 
 		 435 aa  403  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  52.64 
 
 		 440 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  54.38 
 
 		 458 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  53.46 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  52.64 
 
 		 455 aa  375  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  53.38 
 
 		 455 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2733  glutamyl-tRNA reductase  47.02 
 
 		 477 aa  360  3e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  52.26 
 
 		 448 aa  358  8e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8326  glutamyl-tRNA reductase  52.78 
 
 		 440 aa  358  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0238  glutamyl-tRNA reductase  47.34 
 
 		 473 aa  347  2e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.264008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0485  glutamyl-tRNA reductase  47.77 
 
 		 473 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.472188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4372  glutamyl-tRNA reductase  44.26 
 
 		 501 aa  336  5e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6131  glutamyl-tRNA reductase  47.69 
 
 		 476 aa  334  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0494  glutamyl-tRNA reductase  48.15 
 
 		 430 aa  333  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0617  Glutamyl-tRNA reductase  50.59 
 
 		 442 aa  330  3e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.186934  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  44.8 
 
 		 456 aa  286  4e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  39.27 
 
 		 436 aa  260  4e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  33.03 
 
 		 464 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  36.85 
 
 		 434 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  32.71 
 
 		 464 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  36.43 
 
 		 434 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  36.15 
 
 		 436 aa  250  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  37.73 
 
 		 446 aa  245  9e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  35.4 
 
 		 443 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 458 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  33.56 
 
 		 434 aa  236  9e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  35.29 
 
 		 454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  33.56 
 
 		 434 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  37.37 
 
 		 458 aa  233  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  41.23 
 
 		 473 aa  231  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  31.94 
 
 		 443 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  33.02 
 
 		 438 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  31.38 
 
 		 444 aa  223  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  33.64 
 
 		 421 aa  222  8e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  35.68 
 
 		 441 aa  222  9e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  32.71 
 
 		 443 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  35.43 
 
 		 440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  34.99 
 
 		 461 aa  221  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  34.73 
 
 		 442 aa  219  7e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  33.88 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 		 442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  33.11 
 
 		 436 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  31.15 
 
 		 444 aa  216  9e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  31.15 
 
 		 444 aa  216  9e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  31.29 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  31.06 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  31.06 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  31.06 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  31.06 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  35.66 
 
 		 465 aa  215  9.999999999999999e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  31.06 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  31.06 
 
 		 443 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  30.82 
 
 		 444 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  30.75 
 
 		 450 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  32.95 
 
 		 428 aa  213  5.999999999999999e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  35.2 
 
 		 430 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  27.9 
 
 		 441 aa  209  6e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  32.11 
 
 		 428 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  35.61 
 
 		 425 aa  206  9e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  34.5 
 
 		 451 aa  204  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  32.87 
 
 		 428 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  32.41 
 
 		 443 aa  203  6e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  35.6 
 
 		 414 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  33.56 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  36.34 
 
 		 422 aa  201  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  30.22 
 
 		 448 aa  196  8.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  30.22 
 
 		 448 aa  196  8.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 		 420 aa  195  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  34.18 
 
 		 426 aa  194  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  31.5 
 
 		 422 aa  193  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  30.39 
 
 		 431 aa  193  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  32.72 
 
 		 425 aa  193  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  35.28 
 
 		 425 aa  193  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  36.85 
 
 		 453 aa  193  6e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  32.18 
 
 		 432 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  31.62 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  31.78 
 
 		 420 aa  192  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  31.62 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  31.32 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.02 
 
 		 429 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1236  glutamyl-tRNA reductase  29.56 
 
 		 448 aa  189  7e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116001  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  33.64 
 
 		 422 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 422 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 446 aa  187  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0896  glutamyl-tRNA reductase  31.46 
 
 		 429 aa  187  4e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.583722  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  34.1 
 
 		 440 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  31.18 
 
 		 432 aa  186  7e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0764  glutamyl-tRNA reductase  31.6 
 
 		 428 aa  186  8e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.014297  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0776  glutamyl-tRNA reductase  29.7 
 
 		 436 aa  186  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>