More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6677 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4553  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  72.73 
 
 
442 aa  638    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  82.86 
 
 
424 aa  748    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.06 
 
 
447 aa  656    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6677  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  100 
 
 
431 aa  889    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.43 
 
 
443 aa  659    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0979  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.24 
 
 
439 aa  650    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4458  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  70.83 
 
 
443 aa  633  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4060  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  70.6 
 
 
443 aa  631  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.306589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7686  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  71.29 
 
 
441 aa  634  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  72.82 
 
 
434 aa  632  1e-180  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  73.77 
 
 
428 aa  632  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0286  NADH-quinone oxidoreductase subunit F  73.28 
 
 
428 aa  627  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  71.6 
 
 
433 aa  627  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  70.33 
 
 
438 aa  623  1e-177  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  71.39 
 
 
706 aa  610  1e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07430  NADH dehydrogenase subunit F  70.07 
 
 
449 aa  610  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0432719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0525  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  68.04 
 
 
440 aa  604  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13171  NADH dehydrogenase I chain F nuoF (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain F)  69.64 
 
 
445 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  69.36 
 
 
448 aa  598  1e-170  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  68.38 
 
 
439 aa  595  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1545  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  71.6 
 
 
438 aa  594  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.349481  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0474  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  67.22 
 
 
448 aa  595  1e-169  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1575  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  72.09 
 
 
438 aa  596  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1599  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  72.09 
 
 
438 aa  596  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1279  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  63.95 
 
 
438 aa  588  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2711  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  71.15 
 
 
444 aa  587  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1880  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  69.88 
 
 
441 aa  566  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3224  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.55 
 
 
439 aa  561  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4486  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  69.01 
 
 
438 aa  559  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144316  hitchhiker  0.0024852 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3173  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  67.54 
 
 
446 aa  554  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.5 
 
 
434 aa  459  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.41 
 
 
421 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.11 
 
 
427 aa  433  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.11 
 
 
427 aa  433  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.41 
 
 
426 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.75 
 
 
422 aa  429  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.31 
 
 
446 aa  427  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  49.88 
 
 
425 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  49.88 
 
 
425 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.88 
 
 
426 aa  422  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.02 
 
 
425 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.38 
 
 
425 aa  420  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.3 
 
 
451 aa  421  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.99 
 
 
444 aa  420  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.79 
 
 
449 aa  418  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  50.5 
 
 
436 aa  416  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.65 
 
 
427 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4083  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.16 
 
 
446 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.323862  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  50.25 
 
 
438 aa  409  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.67 
 
 
442 aa  410  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.74 
 
 
456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.79 
 
 
441 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.79 
 
 
441 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.79 
 
 
441 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0877  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.63 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.76 
 
 
467 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.17 
 
 
425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1824  NADH dehydrogenase I, F subunit  49.25 
 
 
436 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1925  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.96 
 
 
445 aa  402  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1440  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49 
 
 
436 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0584655  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1408  NADH dehydrogenase (quinone)  49.75 
 
 
448 aa  404  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344302  normal  0.160337 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5572  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49 
 
 
436 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294569  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1304  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49 
 
 
436 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1135  NADH dehydrogenase I, F subunit  49.25 
 
 
436 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305748  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1066  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49 
 
 
436 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0842517  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2161  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49 
 
 
440 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615795  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0962  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.63 
 
 
453 aa  405  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089517 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5175  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.55 
 
 
452 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82972  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0418  NADH dehydrogenase I, F subunit  49.25 
 
 
436 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0732  NADH dehydrogenase I, F subunit  49.25 
 
 
436 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1295  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49 
 
 
436 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  48.55 
 
 
432 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1355  NADH dehydrogenase I, F subunit  48.99 
 
 
427 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1046  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.12 
 
 
432 aa  399  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2004  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.75 
 
 
442 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462519  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.49 
 
 
429 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.02 
 
 
452 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.26 
 
 
441 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3209  putative NADH dehydrogenase I (chain F), NuoF  48.25 
 
 
442 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489699  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0932  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49 
 
 
431 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5981  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3505  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.63 
 
 
446 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1305  NADH dehydrogenase I subunit F  48.79 
 
 
430 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1632  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.75 
 
 
436 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49 
 
 
436 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.121706  normal  0.072136 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2282  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.75 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.502286  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2244  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.75 
 
 
436 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1373  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.99 
 
 
445 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00215992  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  49 
 
 
431 aa  398  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2438  NADH dehydrogenase I subunit F  48.99 
 
 
445 aa  395  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  48.98 
 
 
426 aa  396  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2209  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49 
 
 
431 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1123  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.49 
 
 
429 aa  396  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2577  NADH dehydrogenase I subunit F  48.99 
 
 
445 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1017  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.13 
 
 
425 aa  395  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1368  NADH dehydrogenase I subunit F  48.99 
 
 
445 aa  396  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.104051  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1498  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.06 
 
 
458 aa  396  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275368  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.89 
 
 
452 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1316  NADH dehydrogenase I subunit F  51.18 
 
 
433 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132795  normal  0.0201547 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0826  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.12 
 
 
432 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.725894  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3630  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.28 
 
 
424 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.414875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>