More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6641 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  100 
 
 		 266 aa  533  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  65.11 
 
 		 267 aa  331  9e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  62.86 
 
 		 306 aa  324  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  61.43 
 
 		 272 aa  316  3e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  71.12 
 
 		 238 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  68.07 
 
 		 270 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  68.07 
 
 		 270 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  71.36 
 
 		 271 aa  304  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  70.89 
 
 		 266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  72.33 
 
 		 272 aa  301  6.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  72.38 
 
 		 276 aa  301  9e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  73.76 
 
 		 299 aa  296  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  63.56 
 
 		 242 aa  288  9e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  64.11 
 
 		 242 aa  286  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  70.85 
 
 		 238 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  68.34 
 
 		 266 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  66.83 
 
 		 273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  67.34 
 
 		 250 aa  276  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  68.32 
 
 		 273 aa  275  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  63.16 
 
 		 277 aa  275  7e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  64.68 
 
 		 280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  67.51 
 
 		 265 aa  271  8.000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  63.71 
 
 		 228 aa  266  2e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2995  NusG antitermination factor  64.36 
 
 		 287 aa  265  8e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5965  NusG antitermination factor  62.98 
 
 		 269 aa  263  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.981962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  59.03 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  64.32 
 
 		 273 aa  258  6e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2707  NusG antitermination factor  63.08 
 
 		 267 aa  258  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17300  transcription termination/antitermination factor NusG  54.9 
 
 		 275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0909  NusG antitermination factor  66.34 
 
 		 262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269153  normal  0.196956 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0675  NusG antitermination factor  65.84 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2677  NusG antitermination factor  62.34 
 
 		 255 aa  251  6e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23990  transcription antitermination protein nusG  57.89 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160343  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21030  transcription antitermination protein nusG  59.81 
 
 		 296 aa  249  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0843287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0695  transcription termination/antitermination factor NusG  56.25 
 
 		 317 aa  236  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3162  NusG antitermination factor  64.95 
 
 		 259 aa  235  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.204879 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  48.67 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  56.52 
 
 		 176 aa  208  6e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  50 
 
 		 194 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  52.72 
 
 		 178 aa  198  9e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  50 
 
 		 194 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  50.27 
 
 		 188 aa  195  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  54.3 
 
 		 181 aa  195  8.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  51.63 
 
 		 175 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1622  transcription antiterminator  43.82 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000761547  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  50.54 
 
 		 181 aa  193  3e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  52.72 
 
 		 178 aa  193  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  51.37 
 
 		 175 aa  191  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  49.73 
 
 		 174 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1217  transcription termination/antitermination factor NusG  47.87 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  50.82 
 
 		 187 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  51.34 
 
 		 177 aa  188  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  51.58 
 
 		 185 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  48.63 
 
 		 175 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  49.46 
 
 		 177 aa  185  5e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  49.18 
 
 		 176 aa  185  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  45.74 
 
 		 203 aa  186  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  48.37 
 
 		 177 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  49.73 
 
 		 173 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  52.63 
 
 		 185 aa  183  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  48.09 
 
 		 201 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  48.91 
 
 		 177 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  48.39 
 
 		 182 aa  177  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  50.82 
 
 		 175 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  46.24 
 
 		 178 aa  175  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  48.39 
 
 		 182 aa  175  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  48.39 
 
 		 182 aa  175  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  50.27 
 
 		 176 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  48.63 
 
 		 175 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  48.91 
 
 		 177 aa  171  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  49.73 
 
 		 177 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  47.57 
 
 		 174 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  48.09 
 
 		 177 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  46.77 
 
 		 183 aa  171  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  48.63 
 
 		 172 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  49.46 
 
 		 177 aa  170  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  44.81 
 
 		 180 aa  169  4e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  48.92 
 
 		 177 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  48.92 
 
 		 177 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  48.92 
 
 		 177 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  48.92 
 
 		 177 aa  169  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  48.92 
 
 		 177 aa  169  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  48.92 
 
 		 177 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  48.92 
 
 		 177 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  48.92 
 
 		 177 aa  169  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  45.65 
 
 		 177 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  45.65 
 
 		 177 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  45.65 
 
 		 177 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  47.03 
 
 		 180 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  45.65 
 
 		 177 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  46.99 
 
 		 177 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  43.17 
 
 		 199 aa  166  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  48.39 
 
 		 177 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  46.74 
 
 		 175 aa  166  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  46.74 
 
 		 175 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  44.02 
 
 		 177 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  48.09 
 
 		 176 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  44.02 
 
 		 177 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  45.36 
 
 		 177 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  44.57 
 
 		 177 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>