48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6530 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6530  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0352215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4777  aminoglycoside phosphotransferase  45.45 
 
 
281 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.266614  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2326  aminoglycoside phosphotransferase  43.7 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030159 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1031  trifolitoxin immunity protein  38.28 
 
 
263 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4156  trifolitoxin immunity protein  38.37 
 
 
263 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000289256  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3328  aminoglycoside phosphotransferase  37.69 
 
 
264 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1230  trifolitoxin immunity domain-containing protein  37.94 
 
 
263 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000170799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1053  trifolitoxin immunity domain-containing protein  37.45 
 
 
262 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000137711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1133  trifolitoxin immunity domain-containing protein  37.45 
 
 
262 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000583619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1028  trifolitoxin immunity protein  37.89 
 
 
263 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1183  trifolitoxin immunity protein  37.55 
 
 
263 aa  158  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00210871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1288  trifolitoxin immunity domain protein  37.01 
 
 
263 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000214818  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04894  hypothetical protein  36.69 
 
 
261 aa  156  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1186  aminoglycoside phosphotransferase  42.02 
 
 
286 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1296  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 
295 aa  142  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240005  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000753  hypothetical protein  33.87 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1471  putative antibiotic resistance protein  36.14 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.292447  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4227  aminoglycoside phosphotransferase  40.65 
 
 
324 aa  138  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.722733 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5377  aminoglycoside phosphotransferase  36.59 
 
 
265 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.556886  normal  0.652804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2126  aminoglycoside phosphotransferase  38.68 
 
 
247 aa  135  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.171035  normal  0.0430024 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1068  aminoglycoside phosphotransferase  41.56 
 
 
252 aa  134  9e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0761  aminoglycoside phosphotransferase  36.67 
 
 
273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230447  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3172  aminoglycoside phosphotransferase  37.4 
 
 
257 aa  125  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0232436  hitchhiker  0.0000000099783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5213  putative aminoglycoside phosphotransferase protein (antibiotic resistance protein)  41.71 
 
 
279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1395  putative trifolitoxin immunity protein  41.62 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.815075  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1734  aminoglycoside phosphotransferase  42.21 
 
 
283 aa  108  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7402  hypothetical protein  42.6 
 
 
266 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1421  putative trifolitoxin immunity protein  41.62 
 
 
254 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0079  aminoglycoside phosphotransferase  41.04 
 
 
259 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0822  hypothetical protein  44.1 
 
 
219 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740155  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2798  aminoglycoside phosphotransferase  38.79 
 
 
264 aa  105  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2954  aminoglycoside phosphotransferase  39.24 
 
 
255 aa  104  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00316699  decreased coverage  0.00012693 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2262  aminoglycoside phosphotransferase  38.85 
 
 
253 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.657806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2040  aminoglycoside phosphotransferase  38.12 
 
 
277 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5537  aminoglycoside phosphotransferase  40.46 
 
 
268 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72204  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1212  trifolitoxin immunity protein  37.31 
 
 
140 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3867  aminoglycoside phosphotransferase  31.85 
 
 
264 aa  96.7  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499671  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14970  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  33.98 
 
 
256 aa  95.5  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.448489  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3956  aminoglycoside phosphotransferase  33.95 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1013  aminoglycoside phosphotransferase  40.18 
 
 
279 aa  87.8  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2966  aminoglycoside phosphotransferase  33.47 
 
 
252 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1984  putative TfxG-like immunity protein against TfxA-like peptides  38.64 
 
 
291 aa  85.5  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35590  phosphotransferase family protein  33.61 
 
 
269 aa  81.6  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.886492  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2772  aminoglycoside phosphotransferase  31.76 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13550  aminoglycoside phosphotransferase  40 
 
 
312 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.669259  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3335  aminoglycoside phosphotransferase  43.64 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244161  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0393  aminoglycoside phosphotransferase  50.94 
 
 
301 aa  42  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.948995  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  28.74 
 
 
244 aa  42  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>