More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6420 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
605 aa  1205  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05660  serine/threonine protein kinase  57.96 
 
 
419 aa  305  2e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
535 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  45.81 
 
 
525 aa  247  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  47.74 
 
 
776 aa  236  1e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  44.09 
 
 
563 aa  236  1e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  49.06 
 
 
632 aa  233  8e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.33 
 
 
678 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  45.76 
 
 
391 aa  225  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  45.45 
 
 
675 aa  224  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  41.64 
 
 
562 aa  223  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  46.21 
 
 
659 aa  223  7e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  47.1 
 
 
411 aa  222  1e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  46.22 
 
 
468 aa  219  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  46.3 
 
 
470 aa  219  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  45.91 
 
 
855 aa  218  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  46.97 
 
 
528 aa  217  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  45.56 
 
 
571 aa  216  1e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  44.32 
 
 
695 aa  216  1e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  47.51 
 
 
621 aa  214  4e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3969  serine/threonine protein kinase  49 
 
 
575 aa  213  7e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.87 
 
 
531 aa  212  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  43.75 
 
 
674 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  46.46 
 
 
419 aa  211  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  44.92 
 
 
422 aa  211  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  45.82 
 
 
638 aa  210  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  1.82668e-05 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  45.19 
 
 
525 aa  210  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.67 
 
 
668 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  43.23 
 
 
575 aa  209  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  45.42 
 
 
501 aa  209  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
487 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.8 
 
 
521 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  49.61 
 
 
659 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  44.2 
 
 
554 aa  207  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  45.56 
 
 
703 aa  206  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  46.1 
 
 
705 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  48.02 
 
 
534 aa  206  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6521  serine/threonine protein kinase  44.71 
 
 
553 aa  203  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  42.37 
 
 
418 aa  202  1e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  48.03 
 
 
631 aa  202  2e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1978  protein kinase  46.95 
 
 
482 aa  201  4e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193562  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16830  serine/threonine protein kinase  44.27 
 
 
559 aa  200  7e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.753908  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  41.09 
 
 
509 aa  200  8e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  42.36 
 
 
1029 aa  196  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  38.7 
 
 
493 aa  196  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  40.91 
 
 
674 aa  196  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  40.46 
 
 
596 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  43.13 
 
 
385 aa  194  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  44.66 
 
 
466 aa  194  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2069  serine/threonine protein kinase  45.62 
 
 
501 aa  193  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.832371  normal  0.49505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  41.82 
 
 
493 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  39.69 
 
 
766 aa  191  3e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  44.15 
 
 
595 aa  190  6e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  43.43 
 
 
461 aa  190  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.2 
 
 
512 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  43.46 
 
 
503 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1744  Serine/threonine protein kinase-related protein  40.15 
 
 
405 aa  187  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.679027  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  41.83 
 
 
460 aa  181  3e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5900  serine/threonine protein kinase  41.26 
 
 
476 aa  180  6e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377642  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  41.86 
 
 
666 aa  180  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2134  serine/threonine protein kinase  42.75 
 
 
564 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26171  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  43.03 
 
 
377 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  44.87 
 
 
345 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.18 
 
 
627 aa  178  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  42.22 
 
 
507 aa  177  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  44.09 
 
 
468 aa  176  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  37.38 
 
 
776 aa  174  3e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5247  serine/threonine protein kinase  40.48 
 
 
498 aa  173  7e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592329 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.52 
 
 
598 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  1.13845e-05  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  43.29 
 
 
658 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0144  serine/threonine protein kinase  41.07 
 
 
650 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  39.06 
 
 
673 aa  169  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  40.15 
 
 
646 aa  168  3e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.09 
 
 
446 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  38.67 
 
 
596 aa  167  7e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  37.79 
 
 
468 aa  166  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3315  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.02 
 
 
661 aa  166  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  38.74 
 
 
625 aa  166  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  36.05 
 
 
612 aa  166  2e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0294  serine/threonine protein kinase  38.03 
 
 
757 aa  165  2e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0633635  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  39.41 
 
 
557 aa  166  2e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  39.07 
 
 
465 aa  165  2e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.89 
 
 
579 aa  165  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  43.3 
 
 
468 aa  164  4e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  38.22 
 
 
593 aa  164  4e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2140  serine/threonine protein kinase  41.83 
 
 
532 aa  164  5e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  39.53 
 
 
721 aa  164  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3516  serine/threonine protein kinase  41.38 
 
 
481 aa  164  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  42.15 
 
 
497 aa  163  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.33 
 
 
591 aa  163  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  41.41 
 
 
583 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  38.95 
 
 
543 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  38.82 
 
 
502 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0027  serine/threonine protein kinase  40.08 
 
 
473 aa  162  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  40.08 
 
 
642 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.78 
 
 
532 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0726  serine/threonine protein kinase  39.43 
 
 
556 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.41 
 
 
551 aa  162  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  39.69 
 
 
403 aa  161  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.92 
 
 
1655 aa  161  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>