More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6390 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  72.35 
 
 		 529 aa  768    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  73.72 
 
 		 542 aa  763    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  100 
 
 		 543 aa  1102    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  85.01 
 
 		 546 aa  963    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  65.67 
 
 		 527 aa  703    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  76.24 
 
 		 534 aa  837    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  75.14 
 
 		 542 aa  830    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  75.94 
 
 		 552 aa  820    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  63.83 
 
 		 516 aa  659    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  77.07 
 
 		 541 aa  820    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  77.11 
 
 		 536 aa  842    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  72.56 
 
 		 531 aa  786    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  71.45 
 
 		 551 aa  780    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  68.47 
 
 		 529 aa  747    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  70.65 
 
 		 549 aa  775    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  63.17 
 
 		 516 aa  647    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  71.62 
 
 		 532 aa  770    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  75.32 
 
 		 529 aa  827    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  62.4 
 
 		 522 aa  662    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  72.13 
 
 		 548 aa  789    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  76.27 
 
 		 524 aa  834    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  71.85 
 
 		 556 aa  798    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  62.13 
 
 		 550 aa  657    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  67.23 
 
 		 527 aa  717    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  70.41 
 
 		 531 aa  742    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  76.08 
 
 		 527 aa  821    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  70.24 
 
 		 526 aa  764    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  78.15 
 
 		 530 aa  846    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  67.61 
 
 		 527 aa  734    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  75.23 
 
 		 530 aa  810    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  77.34 
 
 		 540 aa  846    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  71.85 
 
 		 556 aa  798    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  70.28 
 
 		 534 aa  731    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  72.06 
 
 		 542 aa  796    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  71.85 
 
 		 556 aa  798    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  62.64 
 
 		 516 aa  670    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  74.21 
 
 		 537 aa  812    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  78.6 
 
 		 536 aa  835    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  72.98 
 
 		 538 aa  802    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  75.89 
 
 		 527 aa  822    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  61.6 
 
 		 518 aa  632  1e-180  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  59.85 
 
 		 520 aa  627  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  58.33 
 
 		 531 aa  617  1e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  57.63 
 
 		 515 aa  615  1e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  59.09 
 
 		 516 aa  617  1e-175  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  60.11 
 
 		 520 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  58.46 
 
 		 508 aa  614  9.999999999999999e-175  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  57.63 
 
 		 515 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  59.51 
 
 		 513 aa  610  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  59.77 
 
 		 519 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  57.06 
 
 		 528 aa  606  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  57.93 
 
 		 510 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  57.36 
 
 		 510 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  56.49 
 
 		 511 aa  601  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  56.27 
 
 		 510 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  55.3 
 
 		 517 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  57.22 
 
 		 510 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  57.6 
 
 		 510 aa  603  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  59.39 
 
 		 519 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  57.82 
 
 		 518 aa  601  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  57.74 
 
 		 510 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  57.36 
 
 		 510 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  59.39 
 
 		 519 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  57.36 
 
 		 510 aa  598  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  57.12 
 
 		 519 aa  598  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  56.21 
 
 		 516 aa  599  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  57.55 
 
 		 510 aa  599  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  57.36 
 
 		 510 aa  598  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  57.17 
 
 		 510 aa  600  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  57.74 
 
 		 510 aa  600  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  56.21 
 
 		 510 aa  595  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  56.41 
 
 		 514 aa  595  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  57.25 
 
 		 513 aa  595  1e-169  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  56.98 
 
 		 512 aa  598  1e-169  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  56.31 
 
 		 522 aa  595  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  55.64 
 
 		 510 aa  597  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  56.02 
 
 		 510 aa  593  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  56.68 
 
 		 510 aa  593  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  56.98 
 
 		 510 aa  594  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  54.39 
 
 		 514 aa  593  1e-168  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  56.79 
 
 		 510 aa  594  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  55.03 
 
 		 513 aa  593  1e-168  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  55.92 
 
 		 513 aa  592  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  54.77 
 
 		 516 aa  593  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  55.45 
 
 		 510 aa  589  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  56.44 
 
 		 519 aa  590  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  56.41 
 
 		 510 aa  591  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1735  carboxyl transferase  56.87 
 
 		 510 aa  589  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  56.65 
 
 		 512 aa  591  1e-167  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  57.25 
 
 		 516 aa  588  1e-167  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  55.83 
 
 		 510 aa  591  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1401  carboxyl transferase  56.35 
 
 		 510 aa  585  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0947587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  55.34 
 
 		 518 aa  587  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  55.07 
 
 		 510 aa  586  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  55.16 
 
 		 523 aa  586  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5024  putative propionyl-CoA carboxylase beta chain  55.83 
 
 		 510 aa  587  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.541202 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  56.3 
 
 		 514 aa  587  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  56.79 
 
 		 510 aa  588  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  54.49 
 
 		 510 aa  585  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  56.11 
 
 		 510 aa  587  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>