More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6364 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  100 
 
 		 398 aa  815    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  46.62 
 
 		 399 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  38.85 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  41.5 
 
 		 395 aa  276  6e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  32.22 
 
 		 404 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  29.51 
 
 		 451 aa  137  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  28.91 
 
 		 378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  29.92 
 
 		 383 aa  126  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  27.83 
 
 		 391 aa  119  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  27.4 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  27.97 
 
 		 368 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  26.23 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  26.33 
 
 		 361 aa  109  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  29.02 
 
 		 390 aa  106  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  26.34 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  29.95 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  24.86 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  26.1 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  26.7 
 
 		 433 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.22 
 
 		 390 aa  99.8  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  24.87 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  27.81 
 
 		 395 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  24.58 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  25.92 
 
 		 369 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  27.91 
 
 		 414 aa  94.4  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  27.45 
 
 		 407 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5370  integrase family protein  27 
 
 		 498 aa  93.2  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  28.3 
 
 		 397 aa  92.8  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  25.58 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  24.1 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  25.4 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.17 
 
 		 378 aa  91.3  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  26.82 
 
 		 451 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  26.77 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3352  hypothetical protein  66.67 
 
 		 83 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.699307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  26.24 
 
 		 477 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  26.49 
 
 		 409 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  28.57 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 386 aa  87.4  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  29.59 
 
 		 377 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  28 
 
 		 365 aa  86.3  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  25.84 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  29.9 
 
 		 378 aa  86.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  28.28 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  27.9 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  25.61 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  26.33 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  24.86 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  27.3 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  24.06 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.06 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  24.37 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  24.77 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  29.87 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  25.33 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  26.11 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  25.08 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  24.91 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  28.33 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  23.92 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  27.69 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  24.61 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.36 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0882  phage integrase family protein  26.02 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.520245  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  23.69 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  26.6 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.08 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.08 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  27.11 
 
 		 367 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  23.23 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  26.94 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  24.51 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  26.03 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  23.23 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  23.28 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  26.03 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  22.79 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  26.27 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  23.86 
 
 		 380 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  26.81 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  25.79 
 
 		 368 aa  72.8  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  22.67 
 
 		 451 aa  72.4  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  27.62 
 
 		 275 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  29.17 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2508  phage integrase family protein  25.34 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3873  integrase family protein  24.9 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00124247  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  24.36 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  23.28 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  25.54 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  25.72 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  25.15 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1593  putative tyrosine recombinase XerD  28.92 
 
 		 184 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.611626  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8918  integrase family protein  22.83 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0126697  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  28.97 
 
 		 451 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25 
 
 		 325 aa  69.3  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  24.52 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  27.3 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  32.24 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  26.47 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000114455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>