14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6362 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0922  hypothetical protein  64.92 
 
 		 527 aa  664    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6362  hypothetical protein  100 
 
 		 555 aa  1122    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5522  replication initiator protein  51.1 
 
 		 569 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0195674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5326  replication initiator protein  49.1 
 
 		 572 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5539  replication initiator protein  51.34 
 
 		 573 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1030  hypothetical protein  50.19 
 
 		 572 aa  464  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6307  replication initiator protein  50.86 
 
 		 572 aa  465  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0041  hypothetical protein  48.52 
 
 		 552 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0693  hypothetical protein  46.62 
 
 		 550 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270288 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5291  hypothetical protein  44.6 
 
 		 568 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.872454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0150  hypothetical protein  46.59 
 
 		 577 aa  445  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8558  replication initiator protein  45.35 
 
 		 543 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404857  hitchhiker  0.00106122 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0404  hypothetical protein  49.67 
 
 		 476 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2945  hypothetical protein  42.86 
 
 		 56 aa  43.9  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>