14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6359 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6359  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  287  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5287  hypothetical protein  39.85 
 
 		 136 aa  83.6  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4271  hypothetical protein  42.75 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000446812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8555  hypothetical protein  39.2 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149601  hitchhiker  0.000517755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5329  hypothetical protein  43 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0343957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1026  hypothetical protein  42 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.533429 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1140  hypothetical protein  42 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.180925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0153  hypothetical protein  36.5 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5541  plasmid replication, integration and excision activator  41 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6310  plasmid replication, integration and excision activator  41 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.370605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0918  hypothetical protein  37.31 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5525  hypothetical protein  43.43 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0698  hypothetical protein  41.41 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.353371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0045  hypothetical protein  37.11 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>