More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6358 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6358  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
127 aa  246  9e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0917  transcriptional regulator, GntR family  48.65 
 
 
280 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0086  GntR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
126 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8668  putative transcriptional regulator, GntR family  43.12 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  49.23 
 
 
241 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  51.43 
 
 
261 aa  71.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  51.39 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0759  GntR domain protein  41.11 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0739  GntR domain protein  42.22 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0933877  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  37.17 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
243 aa  68.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  48.48 
 
 
251 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  45.07 
 
 
239 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  45.07 
 
 
239 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
245 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  55.74 
 
 
263 aa  66.6  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  43.66 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  45.95 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7288  putative transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.767574 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5518  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0560672  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  39.56 
 
 
253 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4955  putative transcriptional regulator, GntR family  39.74 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203243  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 
254 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0033  GntR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
264 aa  65.1  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
249 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  43.48 
 
 
243 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0121  regulatory protein GntR, HTH  30.77 
 
 
251 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000430087  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0126  regulatory protein GntR HTH  30.77 
 
 
251 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0616081  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  47.89 
 
 
240 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  46.67 
 
 
260 aa  64.3  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  47.89 
 
 
240 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  43.66 
 
 
239 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  50.82 
 
 
257 aa  63.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  43.66 
 
 
239 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  41 
 
 
251 aa  63.9  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  43.66 
 
 
239 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  42.65 
 
 
244 aa  63.5  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  47.89 
 
 
240 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  39.19 
 
 
241 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1175  transcriptional regulator, GntR family  42.03 
 
 
243 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336656  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 
251 aa  62.8  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3466  GntR domain protein  36.67 
 
 
255 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  41.77 
 
 
252 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 
270 aa  62.8  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 
126 aa  62  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3827  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
241 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000115432  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3644  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
241 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000015219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3534  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
241 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3552  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
241 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000156327  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3509  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
276 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393643  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3928  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
241 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000328023  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3895  putative transcriptional regulator  43.08 
 
 
249 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.221719  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3840  transcriptional regulator, GntR family  42.47 
 
 
241 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3805  transcriptional regulator, GntR family  42.47 
 
 
241 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78065e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  39.18 
 
 
243 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 
242 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1408  transcriptional regulator, GntR family  36.96 
 
 
241 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166649  hitchhiker  0.000517226 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3563  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
246 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3567  GntR domain-containing protein  37.5 
 
 
245 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  46.15 
 
 
250 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  43.42 
 
 
277 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
233 aa  61.6  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0995  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
249 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352191  normal  0.964514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  39.73 
 
 
252 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  43.59 
 
 
254 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1930  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.64 
 
 
498 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199389  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
239 aa  60.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
241 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  51.61 
 
 
250 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  45.9 
 
 
239 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
241 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
241 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
241 aa  60.8  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
241 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4653  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
241 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
241 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  45.16 
 
 
242 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
251 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3169  hypothetical protein  39.32 
 
 
461 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  34.51 
 
 
241 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  36.84 
 
 
474 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1778  aminotransferase, classes I and II superfamily  36.84 
 
 
474 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 
239 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4518  transcriptional regulator, GntR family  45.71 
 
 
272 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 
287 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1572  GntR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
288 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
240 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0769  transcriptional regulator, GntR family  45.71 
 
 
272 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1119  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
257 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1743  aminotransferase  36.84 
 
 
474 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5835  histidine utilization repressor  46.27 
 
 
251 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 
241 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1713  aminotransferase, classes I and II superfamily  36.84 
 
 
474 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3470  regulatory protein GntR HTH  36.11 
 
 
364 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000106127  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
243 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>