25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6283 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6283  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  727    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.345992  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0516  hypothetical protein  37.26 
 
 		 361 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000163544  normal  1 
 
 
 
NC_010501  PputW619_0685  hypothetical protein  35.79 
 
 		 374 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.00000000242198  unclonable  0.0000000000000118124 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3550  hypothetical protein  46.97 
 
 		 367 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1013  hypothetical protein  27.45 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0132535  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2528  hypothetical protein  26.64 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000441271  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0025  hypothetical protein  26.64 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000509485  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0025  hypothetical protein  26.64 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000254674  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5841  hypothetical protein  35.37 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0796371  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2989  hypothetical protein  32.96 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2758  hypothetical protein  29.55 
 
 		 205 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13362 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  23.53 
 
 		 583 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3173  hypothetical protein  33.55 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3215  hypothetical protein  32.96 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1116  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  28.87 
 
 		 679 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1872  hypothetical protein  33.73 
 
 		 201 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4114  hypothetical protein  30.89 
 
 		 186 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0840  hypothetical protein  28.17 
 
 		 606 aa  51.6  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.08 
 
 		 559 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.98 
 
 		 559 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  27.69 
 
 		 844 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0970  ATPase, AAA family  28.57 
 
 		 844 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  27.69 
 
 		 843 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  27.69 
 
 		 847 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  27.69 
 
 		 792 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>