More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6231 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  68.48 
 
 		 195 aa  256  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  58.47 
 
 		 196 aa  204  9e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  64.42 
 
 		 197 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  55.43 
 
 		 195 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  57.87 
 
 		 182 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  53.76 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  61.05 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 207 aa  164  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  57.54 
 
 		 194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  50.81 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 190 aa  158  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 206 aa  159  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  55.49 
 
 		 199 aa  158  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  51.88 
 
 		 215 aa  154  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  53.5 
 
 		 160 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  48.13 
 
 		 193 aa  143  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  47.8 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  49.38 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 220 aa  115  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  46.81 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  37.42 
 
 		 400 aa  96.3  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 363 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 408 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 425 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 238 aa  85.9  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 241 aa  81.6  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  34.87 
 
 		 390 aa  75.1  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  34.21 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 346 aa  72.4  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 424 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 406 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 206 aa  67.8  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  36.77 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 451 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 451 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 428 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 385 aa  65.1  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 235 aa  64.7  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  32.08 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  44.59 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2365  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227272  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  44.59 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  42.68 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  50.82 
 
 		 470 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  40.45 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 412 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  35.97 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>