287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6199 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  100 
 
 
425 aa  806    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2645  PEP phosphonomutase  60.71 
 
 
295 aa  207  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.327181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  51.79 
 
 
255 aa  206  8e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4484  PEP phosphonomutase  57.94 
 
 
264 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000284716  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0410  hypothetical protein  52.21 
 
 
258 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2024  hypothetical protein  49.21 
 
 
274 aa  176  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0525538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12030  hypothetical protein  43.67 
 
 
258 aa  171  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2418  hypothetical protein  50.61 
 
 
242 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206237  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  36.84 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  34.19 
 
 
274 aa  149  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  34.33 
 
 
274 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  33.74 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  40.44 
 
 
282 aa  130  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3606  hypothetical protein  40.09 
 
 
282 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.647928  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3408  hypothetical protein  39.74 
 
 
277 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  38.49 
 
 
282 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3519  hypothetical protein  44.84 
 
 
249 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.596575  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3483  hypothetical protein  38.49 
 
 
282 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  36.71 
 
 
284 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  36.78 
 
 
256 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  41.25 
 
 
278 aa  123  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  36.36 
 
 
256 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  35.96 
 
 
258 aa  121  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  40 
 
 
268 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  38.25 
 
 
274 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  41.3 
 
 
286 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  39.69 
 
 
278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  38.87 
 
 
276 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  38.02 
 
 
258 aa  110  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  35.71 
 
 
253 aa  110  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  36.73 
 
 
288 aa  109  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  39.27 
 
 
276 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  37.8 
 
 
275 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0552  PEP phosphonomutase and related enzyme-like protein  41.37 
 
 
254 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  36.86 
 
 
253 aa  107  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  44.14 
 
 
289 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2281  hypothetical protein  42.24 
 
 
253 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0220  hypothetical protein  37.96 
 
 
267 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  35.42 
 
 
264 aa  103  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  38.43 
 
 
279 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.71 
 
 
271 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  35.22 
 
 
266 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  34.69 
 
 
278 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  38.4 
 
 
276 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  35.59 
 
 
253 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  34.6 
 
 
271 aa  100  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  41.42 
 
 
286 aa  100  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  37.65 
 
 
276 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  39.22 
 
 
286 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3426  hypothetical protein  33.04 
 
 
269 aa  98.6  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  35.37 
 
 
280 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5509  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  40.34 
 
 
273 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  36.71 
 
 
276 aa  97.4  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  33.73 
 
 
274 aa  96.7  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1389  hypothetical protein  36.99 
 
 
275 aa  96.3  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000372272  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1920  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein  31.91 
 
 
271 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181834 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0266  hypothetical protein  35.5 
 
 
252 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.235193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0256  hypothetical protein  35.5 
 
 
252 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0246  hypothetical protein  35.5 
 
 
252 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0391  hypothetical protein  35.34 
 
 
253 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1688  PEP phosphonomutase  36.47 
 
 
279 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.251205  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  34.66 
 
 
278 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  38.46 
 
 
279 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  36.23 
 
 
274 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  35.83 
 
 
272 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  36.16 
 
 
279 aa  92.8  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  36.05 
 
 
294 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  35.85 
 
 
274 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8089  PEP phosphonomutase  33.33 
 
 
274 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  31.56 
 
 
276 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  33.88 
 
 
274 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4063  hypothetical protein  36.75 
 
 
267 aa  90.9  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.196405  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  33.05 
 
 
278 aa  90.5  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  35.53 
 
 
276 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3283  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  34.07 
 
 
255 aa  89.7  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1447  PEP phosphonomutase and related enzymes  37.83 
 
 
249 aa  89  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  33.19 
 
 
275 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3473  PEP phosphonomutase  36 
 
 
255 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0613154  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2157  hypothetical protein  35.51 
 
 
265 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  32.11 
 
 
269 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12660  PEP phosphonomutase-like enzyme  40.34 
 
 
271 aa  87.8  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  36.09 
 
 
281 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  33.47 
 
 
278 aa  86.3  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06151  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07230)  32.95 
 
 
274 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0384157  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5112  hypothetical protein  34.73 
 
 
273 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  35.37 
 
 
273 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5295  PEP phosphonomutase  36.59 
 
 
255 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0426519  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1639  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  35.77 
 
 
260 aa  85.5  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  0.866328 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3644  hypothetical protein  33.6 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0289  hypothetical protein  33.62 
 
 
252 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0122  hypothetical protein  35.57 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  32.64 
 
 
280 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  36.95 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2560  PEP phosphonomutase  35.77 
 
 
253 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2982  PEP phosphonomutase  33.86 
 
 
258 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3563  PEP phosphonomutase  36.36 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.456792  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  34.5 
 
 
306 aa  77  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  35.68 
 
 
286 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  35.68 
 
 
286 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  35.68 
 
 
286 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>