199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6180 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  50.12 
 
 		 818 aa  760    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  65.74 
 
 		 824 aa  1063    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  53.6 
 
 		 840 aa  802    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  51.18 
 
 		 843 aa  746    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  49.28 
 
 		 843 aa  710    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  49.27 
 
 		 817 aa  758    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  100 
 
 		 812 aa  1627    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  60.12 
 
 		 831 aa  956    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  51.06 
 
 		 880 aa  826    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  62.18 
 
 		 846 aa  982    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  54.99 
 
 		 799 aa  746    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  55.53 
 
 		 829 aa  843    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  33.88 
 
 		 813 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  38.18 
 
 		 845 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.1 
 
 		 813 aa  437  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  33.78 
 
 		 864 aa  432  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.96 
 
 		 845 aa  418  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  36.86 
 
 		 786 aa  414  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  36.21 
 
 		 785 aa  413  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  36.13 
 
 		 875 aa  397  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  33.45 
 
 		 860 aa  399  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.07 
 
 		 835 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  32.68 
 
 		 793 aa  387  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  35.04 
 
 		 819 aa  383  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  32.63 
 
 		 863 aa  381  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  31.31 
 
 		 837 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  37.14 
 
 		 833 aa  381  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  34 
 
 		 891 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  33.82 
 
 		 891 aa  379  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  35.48 
 
 		 839 aa  372  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.71 
 
 		 872 aa  367  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  31.24 
 
 		 871 aa  366  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  33.17 
 
 		 819 aa  365  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.57 
 
 		 842 aa  363  8e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  32.03 
 
 		 819 aa  361  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  31.82 
 
 		 815 aa  358  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  29.83 
 
 		 802 aa  355  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  33.5 
 
 		 824 aa  352  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  31.83 
 
 		 861 aa  348  3e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  30.93 
 
 		 837 aa  347  8e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  29.87 
 
 		 802 aa  344  4e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  34.14 
 
 		 823 aa  344  4e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  33.28 
 
 		 847 aa  316  9e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  30.29 
 
 		 838 aa  315  1.9999999999999998e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  30.54 
 
 		 940 aa  271  2.9999999999999997e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  39.32 
 
 		 897 aa  259  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  26.02 
 
 		 845 aa  206  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  30.32 
 
 		 763 aa  200  7.999999999999999e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  32.38 
 
 		 663 aa  197  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.87 
 
 		 826 aa  180  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.25 
 
 		 826 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  26.99 
 
 		 816 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6019  mannosidase  28.38 
 
 		 820 aa  155  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  29.19 
 
 		 882 aa  155  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  28.24 
 
 		 882 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  25.95 
 
 		 1144 aa  154  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  28.86 
 
 		 853 aa  153  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  25.3 
 
 		 962 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  23.47 
 
 		 821 aa  137  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  25.83 
 
 		 734 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1808  Beta-mannosidase  29.2 
 
 		 816 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  29.09 
 
 		 811 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  29.24 
 
 		 856 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.95 
 
 		 878 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4156  Beta-mannosidase  28.67 
 
 		 828 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3633  Beta-mannosidase  29.83 
 
 		 827 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4210  Beta-mannosidase  28.67 
 
 		 828 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3307  Beta-mannosidase  28.67 
 
 		 828 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  29.03 
 
 		 839 aa  126  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.87 
 
 		 744 aa  122  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4107  beta-mannosidase  29.45 
 
 		 812 aa  118  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.19 
 
 		 971 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.7 
 
 		 984 aa  104  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  25.12 
 
 		 739 aa  104  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1074  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  33.33 
 
 		 815 aa  103  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0638  glycosy hydrolase family protein  29.34 
 
 		 839 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4395  beta-mannosidase  31.23 
 
 		 825 aa  100  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0815  glycosyl hydrolase family protein  29.06 
 
 		 839 aa  100  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0652  glycosy hydrolase family protein  29.06 
 
 		 839 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0039  beta-mannosidase-related protein  29.15 
 
 		 839 aa  99.4  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2885  beta-mannosidase-related protein  29.15 
 
 		 839 aa  99.4  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2200  beta-mannosidase-related protein  29.15 
 
 		 839 aa  99.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2507  beta-mannosidase-related protein  29.15 
 
 		 839 aa  99.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  24.96 
 
 		 724 aa  99  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  25.8 
 
 		 906 aa  95.5  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.36 
 
 		 720 aa  89.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.62 
 
 		 640 aa  80.9  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.89 
 
 		 757 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.25 
 
 		 901 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.56 
 
 		 905 aa  76.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.9 
 
 		 799 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.88 
 
 		 1362 aa  75.5  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.94 
 
 		 623 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  28.87 
 
 		 888 aa  69.3  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.71 
 
 		 884 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.67 
 
 		 858 aa  68.2  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3323  Beta-galactosidase  27.7 
 
 		 584 aa  67.4  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0719598  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.97 
 
 		 800 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  26.39 
 
 		 980 aa  66.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  26.37 
 
 		 1012 aa  66.2  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>