205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6121 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
285 aa  583  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  54.26 
 
 
289 aa  316  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  49.29 
 
 
291 aa  280  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  41.43 
 
 
410 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  43.59 
 
 
283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  39.36 
 
 
287 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  42.4 
 
 
287 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  38.35 
 
 
285 aa  205  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  39.64 
 
 
283 aa  198  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  38.95 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  38.2 
 
 
293 aa  193  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  38.2 
 
 
293 aa  192  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  53.57 
 
 
212 aa  192  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  37.63 
 
 
285 aa  192  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 
301 aa  192  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  36.97 
 
 
288 aa  191  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  38.72 
 
 
289 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  36.33 
 
 
287 aa  186  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  36.92 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  36.07 
 
 
296 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  35.25 
 
 
288 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  37.3 
 
 
278 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  37.94 
 
 
284 aa  179  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  36.2 
 
 
282 aa  178  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  36.2 
 
 
288 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  34.67 
 
 
292 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  35.84 
 
 
291 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  33.55 
 
 
328 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  33.93 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  34.69 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.3 
 
 
292 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  35.4 
 
 
288 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  36.17 
 
 
300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  37.97 
 
 
281 aa  172  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  36.96 
 
 
290 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  37.63 
 
 
287 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  36.1 
 
 
287 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 
296 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  37.82 
 
 
278 aa  169  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  35.45 
 
 
276 aa  168  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  37.96 
 
 
278 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  37.64 
 
 
292 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  36.86 
 
 
301 aa  166  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  35.4 
 
 
282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  37.45 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  34.86 
 
 
282 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  33.57 
 
 
303 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  36.43 
 
 
301 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  35.51 
 
 
299 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  35.84 
 
 
285 aa  161  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  37.97 
 
 
281 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  34.06 
 
 
282 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.92 
 
 
284 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  34.3 
 
 
295 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  34.19 
 
 
302 aa  156  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  34.73 
 
 
286 aa  156  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  33.57 
 
 
295 aa  155  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  34.43 
 
 
287 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  33.57 
 
 
308 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  33.09 
 
 
294 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  32.49 
 
 
291 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  31.87 
 
 
285 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.46 
 
 
279 aa  149  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  34.04 
 
 
294 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  33.58 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  32.97 
 
 
280 aa  145  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  31.02 
 
 
279 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.91 
 
 
281 aa  142  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  31.75 
 
 
291 aa  142  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  31.64 
 
 
284 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  32.09 
 
 
296 aa  139  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  33.69 
 
 
310 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4270  helix-turn-helix domain protein  36.93 
 
 
290 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  36.43 
 
 
270 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  34.09 
 
 
274 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0030  helix-turn-helix domain protein  33.58 
 
 
302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.02 
 
 
283 aa  133  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8469  transcriptional regulator, XRE family  31.05 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.8 
 
 
278 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5038  helix-turn-helix domain protein  32.38 
 
 
287 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  30.63 
 
 
286 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  30.99 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6434  helix-turn-helix domain protein  30.32 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147514  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  31.56 
 
 
293 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  28.47 
 
 
278 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  32.58 
 
 
277 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12010  predicted transcription factor, MBF1 like protein  29.54 
 
 
284 aa  126  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1005  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 
309 aa  125  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4415  helix-turn-helix domain-containing protein  30.39 
 
 
283 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  27.72 
 
 
288 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  34.59 
 
 
299 aa  123  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2430  transcriptional regulator, XRE family  29.86 
 
 
276 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0902  helix-turn-helix domain protein  31.56 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579826  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  28.99 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0579  transcriptional regulator, XRE family  32.98 
 
 
290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  33.07 
 
 
297 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  32.13 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1874  transcriptional regulator, XRE family  32.12 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4578  transcriptional regulator, XRE family  28.47 
 
 
290 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  29.58 
 
 
284 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>