176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6113 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6113  dihydroxyacetone kinase, L subunit  100 
 
 		 208 aa  381  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29370  dihydroxyacetone kinase, phosphoprotein-dependent, L subunit  65.05 
 
 		 207 aa  214  8e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1660  dihydroxyacetone kinase, L subunit  62.62 
 
 		 218 aa  202  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015384  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1458  dihydroxyacetone kinase, L subunit  65.62 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.031951  normal  0.416542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0173  dihydroxyacetone kinase, L subunit  63.05 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0336  dihydroxyacetone kinase, L subunit  61.81 
 
 		 210 aa  181  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2073  dihydroxyacetone kinase subunit L  45.27 
 
 		 216 aa  179  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0235  dihydroxyacetone kinase family protein  42.72 
 
 		 208 aa  174  8e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.229043  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2045  dihydroxyacetone kinase, L subunit  48.04 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2004  dihydroxyacetone kinase, L subunit  56.59 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.419483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1026  dihydroxyacetone kinase, L subunit  45.19 
 
 		 212 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0152559  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4780  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.02 
 
 		 209 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.512432 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0973  dihydroxyacetone kinase, L subunit  57.14 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001637  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase ADP-binding subunit DhaL  42.38 
 
 		 211 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1767  dihydroxyacetone kinase, L subunit  46.08 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23890  dihydroxyacetone kinase, phosphoprotein-dependent, L subunit  58.95 
 
 		 271 aa  164  9e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0484883  normal  0.421775 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1067  dihydroxyacetone kinase, subunit L  61.88 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1155  dihydroxyacetone kinase, L subunit  62.5 
 
 		 211 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359439  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2057  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.83 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0299195  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2563  dihydroxyacetone kinase, L subunit  58.89 
 
 		 221 aa  158  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.389058  normal  0.0624856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4271  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.35 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.207338 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0073  dihydroxyacetone kinase, L subunit  47.8 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.706959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1555  dihydroxyacetone kinase, L subunit  47.59 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2583  dihydroxyacetone kinase, L subunit  51.02 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  40.98 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1343  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.79 
 
 		 204 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000571378  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3047  dihydroxyacetone kinase, L subunit  57.14 
 
 		 213 aa  153  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2221  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.41 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3298  dihydroxyacetone kinase, L subunit  49.14 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1942  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  40 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2346  dihydroxyacetone kinase, L subunit  57.53 
 
 		 210 aa  146  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.516826  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2008  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.29 
 
 		 210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01174  dihydroxyacetone kinase, C-terminal domain protein  40.98 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2449  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.98 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1179  DAK2 domain-containing protein  45.71 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2329  dihydroxyacetone kinase, L subunit  55.1 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1358  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  40.98 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4110  dihydroxyacetone kinase, L subunit  46.45 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0295747 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1303  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  40.98 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2427  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  40.98 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.52079  normal  0.545105 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01184  hypothetical protein  40.98 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2200  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.74 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000530295  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4857  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  39.05 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1907  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.8 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3916  dihydroxyacetone kinase, L subunit  58.56 
 
 		 209 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1102  dihydroxyacetone kinase, L subunit  50.76 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1081  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.08 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0961  dihydroxyacetone kinase, subunit L  40.78 
 
 		 211 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000657721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1105  dihydroxyacetone kinase, subunit L  40.78 
 
 		 211 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1402  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.3 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0698763  normal  0.808162 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2433  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.72 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.107331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0878  dihydroxyacetone kinase, L subunit  48.73 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2617  dihydroxyacetone kinase, L subunit  54.8 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0276564  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03260  Glycerone kinase  39.9 
 
 		 216 aa  128  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000533446  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2344  DAK2 domain-containing protein  37.23 
 
 		 191 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1459  dihydroxyacetone kinase, L subunit  45.16 
 
 		 252 aa  124  9e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4661  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.94 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.439901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1404  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.9 
 
 		 221 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6365  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.68 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3826  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.16 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0080  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.71 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1651  dihydroxyacetone kinase family protein  38.14 
 
 		 192 aa  118  6e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0039  dihydroxyacetone phosphatase family protein  38.42 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0705  dihydroxyacetone kinase, subunit L  35.64 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  40.58 
 
 		 612 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4752  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.67 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0429021  normal  0.328024 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4394  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0674  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.64 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.13581  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0689  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.64 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0402893  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1571  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.11 
 
 		 201 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0215436  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  39.39 
 
 		 598 aa  114  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1638  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.04 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.275344  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4070  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.03 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1263  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.5 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  41.41 
 
 		 589 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  42.78 
 
 		 567 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1341  Dak phosphatase  42.35 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0650  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.05 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0141931  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3824  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.24 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  42.78 
 
 		 567 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3210  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.95 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1569  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.42 
 
 		 215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.460675  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4072  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.63 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111726  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0355  dihydroxyacetone kinase, subunit L  37.11 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0411  dihydroxyacetone kinase  44 
 
 		 588 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5632  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.27 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1360  Dak phosphatase  46.6 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3125  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.44 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0461  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.78 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0366  dihydroxyacetone kinase, subunit II  42.78 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  32.84 
 
 		 583 aa  102  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1808  dihydroxyacetone kinase family protein  42.27 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112766  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0806  dihydroxyacetone kinase family protein  42.27 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1097  dihydroxyacetone kinase family protein  42.27 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83679  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  41.33 
 
 		 566 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3285  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.57 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0948  hypothetical protein  35.57 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.168342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3418  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.57 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1797  dihydroxyacetone kinase family protein  42.78 
 
 		 554 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.510313  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22050  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.07 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>