More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6067 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  50.35 
 
 		 711 aa  635    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  48.11 
 
 		 720 aa  653    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  50.49 
 
 		 721 aa  651    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  49.22 
 
 		 720 aa  642    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  49.51 
 
 		 721 aa  645    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  48.59 
 
 		 720 aa  643    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  51.28 
 
 		 707 aa  674    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  49.15 
 
 		 714 aa  643    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  50.63 
 
 		 709 aa  647    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  50.43 
 
 		 706 aa  655    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  49.93 
 
 		 708 aa  642    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  49.85 
 
 		 710 aa  636    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  50 
 
 		 706 aa  647    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  48.95 
 
 		 715 aa  653    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  49.79 
 
 		 752 aa  666    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 701 aa  1418    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  51.69 
 
 		 701 aa  664    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  48.8 
 
 		 708 aa  665    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  50.93 
 
 		 701 aa  666    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  50.21 
 
 		 713 aa  659    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  52.83 
 
 		 712 aa  667    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  47.23 
 
 		 776 aa  653    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  49.72 
 
 		 718 aa  656    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  48.37 
 
 		 779 aa  635    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  50.78 
 
 		 704 aa  659    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  48.87 
 
 		 701 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  51.85 
 
 		 703 aa  647    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3089  glycogen debranching enzyme GlgX  58.81 
 
 		 734 aa  768    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000640633  hitchhiker  0.0000151217 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2939  glycogen debranching enzyme GlgX  52.11 
 
 		 707 aa  640    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  50.07 
 
 		 727 aa  639    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  50.14 
 
 		 722 aa  648    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  48.59 
 
 		 722 aa  644    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  49.15 
 
 		 714 aa  644    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  49.79 
 
 		 715 aa  652    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  49.01 
 
 		 721 aa  655    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  54.77 
 
 		 709 aa  697    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  52.5 
 
 		 720 aa  652    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  47.02 
 
 		 707 aa  640    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  48.91 
 
 		 1537 aa  660    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  49.15 
 
 		 726 aa  660    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  47.52 
 
 		 722 aa  636    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  47.15 
 
 		 706 aa  646    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  48.4 
 
 		 720 aa  641    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  48.51 
 
 		 751 aa  647    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  51.98 
 
 		 712 aa  663    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  48.87 
 
 		 710 aa  655    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  53.72 
 
 		 700 aa  687    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  50.5 
 
 		 712 aa  680    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  52.12 
 
 		 712 aa  664    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  49.44 
 
 		 733 aa  641    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  50.63 
 
 		 718 aa  653    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  51.13 
 
 		 711 aa  649    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  48.59 
 
 		 720 aa  643    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  49.15 
 
 		 714 aa  644    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  49.37 
 
 		 721 aa  654    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  49.72 
 
 		 701 aa  649    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  50 
 
 		 714 aa  666    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  49.65 
 
 		 723 aa  665    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  51.69 
 
 		 730 aa  677    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  46.73 
 
 		 709 aa  633  1e-180  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  47.66 
 
 		 711 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  47.66 
 
 		 711 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  48.08 
 
 		 733 aa  631  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  48.3 
 
 		 745 aa  630  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  49.15 
 
 		 720 aa  626  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1070  glycogen debranching enzyme GlgX  47.46 
 
 		 802 aa  625  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  49.08 
 
 		 716 aa  626  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  49.08 
 
 		 704 aa  625  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  49.37 
 
 		 719 aa  627  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  48.94 
 
 		 716 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  47.39 
 
 		 717 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  48.07 
 
 		 728 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  47.25 
 
 		 717 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  48.27 
 
 		 845 aa  615  1e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  48.73 
 
 		 712 aa  618  1e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  47.73 
 
 		 1464 aa  617  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  47.25 
 
 		 717 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3733  glycogen debranching enzyme GlgX  47.23 
 
 		 733 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.635331  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3665  glycogen debranching protein GlgX  46.03 
 
 		 830 aa  613  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  47.88 
 
 		 719 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  48.38 
 
 		 758 aa  610  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  47.05 
 
 		 723 aa  609  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  48.1 
 
 		 755 aa  610  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  47.45 
 
 		 717 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  48.59 
 
 		 779 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  46.62 
 
 		 727 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  47.16 
 
 		 738 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  49.15 
 
 		 729 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  47.16 
 
 		 738 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  48.24 
 
 		 758 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  47.41 
 
 		 756 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  46.68 
 
 		 727 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  46.01 
 
 		 719 aa  599  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0505  glycogen debranching protein GlgX  47.07 
 
 		 714 aa  601  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299874  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  50.15 
 
 		 717 aa  601  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  47.83 
 
 		 757 aa  598  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  46.49 
 
 		 710 aa  598  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  46.57 
 
 		 755 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  49.7 
 
 		 727 aa  590  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  48.64 
 
 		 720 aa  590  1e-167  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>