More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6064 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 331 aa  677    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  79.05 
 
 		 325 aa  511  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  74.45 
 
 		 324 aa  491  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  73.25 
 
 		 320 aa  470  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  68.04 
 
 		 328 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  66.77 
 
 		 332 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  68.04 
 
 		 328 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  68.04 
 
 		 328 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  66.67 
 
 		 341 aa  431  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  64.98 
 
 		 327 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4848  Methyltransferase type 11  70.92 
 
 		 310 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 		 310 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  37.34 
 
 		 266 aa  86.3  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2807  Methyltransferase type 11  45.63 
 
 		 228 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.91 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  40.57 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.9 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  43.24 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  44.44 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.19 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.61 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  44.54 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  41.13 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  42.16 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.19 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.19 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  43.14 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2834  Methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0713675 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.51 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2605  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.21 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0775549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.89 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  31.28 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.67 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  40.78 
 
 		 215 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  42.45 
 
 		 204 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  42.31 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.57 
 
 		 258 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  38.39 
 
 		 226 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.25 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.4 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.36 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.25 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.25 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.25 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  42.57 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  39.62 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.36 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.49 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  42.45 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.71 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.32 
 
 		 251 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  38 
 
 		 189 aa  67  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.36 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.71 
 
 		 277 aa  67  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 280 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.13 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  42.57 
 
 		 204 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  42.57 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  43.4 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  38 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  35.95 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  30.05 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  37.9 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2635  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.3 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  28.22 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  37.39 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.93 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  39.25 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  37.39 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.25 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0932  putative methyltransferase  41.58 
 
 		 217 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  32.64 
 
 		 265 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 209 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  42 
 
 		 202 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  37.2 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  40.4 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  37.37 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  33.88 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  40.38 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.64 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  36.36 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  38.03 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  40.2 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  38.68 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>