50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6063 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  749    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  63.27 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  56.76 
 
 		 412 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  56.76 
 
 		 412 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  56.64 
 
 		 381 aa  353  4e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  56.39 
 
 		 372 aa  350  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  53.54 
 
 		 399 aa  344  2e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  56.58 
 
 		 369 aa  338  8e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  50.92 
 
 		 382 aa  301  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  54.33 
 
 		 358 aa  298  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  47.86 
 
 		 416 aa  270  5e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  0.0000364534 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  42.13 
 
 		 396 aa  182  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  42.22 
 
 		 388 aa  170  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  33.67 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  34.34 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  38.59 
 
 		 428 aa  150  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  38.7 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  34.75 
 
 		 411 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  37.71 
 
 		 423 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  33.16 
 
 		 385 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  37.17 
 
 		 400 aa  139  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  35.99 
 
 		 396 aa  139  7.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  37.01 
 
 		 412 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  37.06 
 
 		 422 aa  137  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  36.25 
 
 		 418 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  37.39 
 
 		 388 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  40.06 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  35 
 
 		 438 aa  129  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  36.89 
 
 		 403 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  35.33 
 
 		 428 aa  113  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  31.21 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  33.43 
 
 		 407 aa  106  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  34.59 
 
 		 443 aa  100  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  36.24 
 
 		 411 aa  93.2  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  32.47 
 
 		 487 aa  87  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  30.15 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  27.43 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  27.33 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  29.65 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  26.09 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  24.8 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  23.92 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  30.81 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.559975 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  25.5 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  25.88 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  20.55 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  26.02 
 
 		 375 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4993  hypothetical protein  22.36 
 
 		 408 aa  53.1  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.513988 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  23.85 
 
 		 431 aa  50.8  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  23.67 
 
 		 394 aa  50.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>