More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6056 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  100 
 
 
248 aa  491  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  67.89 
 
 
259 aa  324  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1869  methyltransferase type 11  67.48 
 
 
259 aa  313  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1915  methyltransferase type 11  67.48 
 
 
259 aa  313  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.107391  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  69.64 
 
 
258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  61.69 
 
 
263 aa  304  9.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  60.8 
 
 
261 aa  293  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  60.32 
 
 
264 aa  293  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  61.16 
 
 
248 aa  289  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  59.92 
 
 
274 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4654  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
257 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.302301  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  41.13 
 
 
1106 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  39.7 
 
 
634 aa  95.1  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  35.03 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4218  methyltransferase type 11  39.55 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
1032 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  30.06 
 
 
208 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  30.95 
 
 
292 aa  68.6  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  36.88 
 
 
870 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
885 aa  67.4  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
210 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2175  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.300294  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2566  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  28.39 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  33.13 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  39.37 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  39.37 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
711 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2143  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.17 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.136766  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6865  Methyltransferase type 11  35.97 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.52 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 
244 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 
810 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.52 
 
 
238 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  33.12 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  40 
 
 
347 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  28.66 
 
 
237 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 
257 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  37.61 
 
 
250 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  27.15 
 
 
279 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1112  methyltransferase type 11  26.9 
 
 
246 aa  62.8  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0760451  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3965  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.25 
 
 
260 aa  62.8  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  38.24 
 
 
242 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.12 
 
 
237 aa  62.4  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
710 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1603  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.28 
 
 
251 aa  62.4  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.905646  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.86 
 
 
246 aa  62.4  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  32.5 
 
 
293 aa  62.4  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  43 
 
 
202 aa  62.4  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.19 
 
 
345 aa  62  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  29.07 
 
 
278 aa  62  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  34.03 
 
 
204 aa  62  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  35.4 
 
 
237 aa  62  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  39.58 
 
 
225 aa  62  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  29.25 
 
 
238 aa  62  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  38.33 
 
 
251 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  36.46 
 
 
202 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  31.75 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.14 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  34.01 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  32.52 
 
 
233 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  35.96 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
317 aa  60.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  30.36 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.98 
 
 
260 aa  61.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  32.52 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  38.79 
 
 
208 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  27.1 
 
 
401 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 
319 aa  60.1  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.71 
 
 
246 aa  60.1  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 
237 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.1 
 
 
277 aa  60.1  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 
242 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  34.97 
 
 
204 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  27.98 
 
 
276 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 
242 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3743  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
331 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 
291 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.22 
 
 
239 aa  59.3  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  38.05 
 
 
204 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2836  methyltransferase type 11  34.45 
 
 
234 aa  59.3  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4822  Methyltransferase type 11  41.05 
 
 
233 aa  59.3  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  36 
 
 
239 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  31.79 
 
 
238 aa  59.3  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  28.57 
 
 
243 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 
210 aa  58.9  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.68 
 
 
256 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3819  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.65 
 
 
248 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  24.5 
 
 
206 aa  58.5  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  35.48 
 
 
204 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 
239 aa  58.5  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  30.93 
 
 
257 aa  58.5  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3246  Methyltransferase type 11  37.1 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00392072  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 
353 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  33.98 
 
 
353 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>