22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6012 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6012  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.72 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.520156 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0484  streptogrisin C. Serine peptidase. MEROPS family S01A  37.59 
 
 		 368 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19510  trypsin family protease proenzyme  37 
 
 		 381 aa  65.9  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  0.125325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0022  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.38 
 
 		 387 aa  52.4  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1492  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 384 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0362438 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4796  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.56 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2441  peptidase alpha-lytic pro domain protein  38.71 
 
 		 349 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000713419  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1493  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.58 
 
 		 381 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.03081 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03540  Trypsin  30.63 
 
 		 366 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4515  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.18 
 
 		 378 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0335182  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3177  peptidase  39.13 
 
 		 344 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2479  streptogrisin C  33.33 
 
 		 501 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0239994  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04150  Trypsin  28.95 
 
 		 392 aa  46.6  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0409839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7728  streptogrisin C  34.34 
 
 		 503 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2955  peptidase  36.96 
 
 		 346 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.869876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5805  peptidase, S1E (streptogrisin A) subfamily  30.69 
 
 		 374 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0814  peptidase alpha-lytic pro domain-containing protein  32 
 
 		 399 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  34.34 
 
 		 488 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2317  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.24 
 
 		 457 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1566  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.93 
 
 		 380 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  31.21 
 
 		 522 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>