More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5776 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
354 aa  701    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  76.38 
 
 
359 aa  531  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  68.11 
 
 
350 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  67.31 
 
 
326 aa  428  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  69.68 
 
 
341 aa  431  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  66.25 
 
 
350 aa  431  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  64.24 
 
 
337 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1651  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.08 
 
 
356 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4915  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  63.84 
 
 
335 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487273  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.14 
 
 
330 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2860  methanol dehydrogenase regulatory protein  66.88 
 
 
325 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692572  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5108  ATPase  65.96 
 
 
342 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.34364  normal  0.11344 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1100  putative regulatory protein  62.99 
 
 
328 aa  409  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3073  ATPase  66.77 
 
 
324 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  63.06 
 
 
351 aa  403  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1000  ATPase  69.31 
 
 
332 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.270469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1405  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  63.27 
 
 
342 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0567323  hitchhiker  0.00186052 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  61.39 
 
 
332 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.766852 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3209  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  61.29 
 
 
339 aa  382  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00106546  normal  0.0189489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1210  ATPase  58.36 
 
 
372 aa  383  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1280  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.3 
 
 
383 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000592788 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3272  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  67.71 
 
 
326 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0220778  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  53.8 
 
 
314 aa  349  4e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.45 
 
 
319 aa  339  4e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  56.61 
 
 
317 aa  338  9e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  51.92 
 
 
327 aa  335  5.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  49.03 
 
 
312 aa  334  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  53.85 
 
 
323 aa  333  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  53.53 
 
 
347 aa  334  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  49.84 
 
 
320 aa  331  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.17 
 
 
321 aa  330  3e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  49.53 
 
 
320 aa  330  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.67 
 
 
325 aa  329  4e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  48.03 
 
 
318 aa  329  4e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0634  ATPase  56.95 
 
 
324 aa  328  6e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00000306223  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2420  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.39 
 
 
325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.83 
 
 
314 aa  325  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.62 
 
 
309 aa  323  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4071  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  54.66 
 
 
331 aa  322  5e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.261708  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3366  ATPase  52.61 
 
 
316 aa  322  8e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  52.26 
 
 
331 aa  321  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3802  ATPase  55.78 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136563  normal  0.371398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  52.58 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.77 
 
 
318 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.83 
 
 
313 aa  318  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  50.5 
 
 
305 aa  317  2e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2560  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.75 
 
 
315 aa  317  3e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.050472  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.76 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1183  ATPase  47.85 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54 
 
 
319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53 
 
 
313 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3810  ATPase  47.08 
 
 
318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4014  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.48 
 
 
312 aa  311  7.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.33 
 
 
322 aa  311  9e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  49.19 
 
 
310 aa  311  1e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  49.17 
 
 
305 aa  311  1e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27460  MoxR-like ATPase  52.34 
 
 
352 aa  310  2e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  49.68 
 
 
320 aa  309  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  49.68 
 
 
320 aa  308  9e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  49.35 
 
 
320 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0460  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.94 
 
 
343 aa  306  2.0000000000000002e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0587  ATPase  56.57 
 
 
316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.131658  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  50.33 
 
 
313 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2775  ATPase  53.23 
 
 
319 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  49.03 
 
 
320 aa  305  6e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  49.83 
 
 
320 aa  305  7e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05630  MoxR-like ATPase  53.38 
 
 
331 aa  305  7e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.609898  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0813  ATPase  52.14 
 
 
310 aa  305  1.0000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4817  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.26 
 
 
330 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16660  MoxR-like ATPase  60.15 
 
 
318 aa  304  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.176276  normal  0.0126218 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1760  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.59 
 
 
333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00353191  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.34 
 
 
327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1331  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.13 
 
 
324 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280532  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21600  MoxR-like ATPase  48.69 
 
 
322 aa  300  4e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264241  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1802  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.12 
 
 
321 aa  298  6e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.916735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3212  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.12 
 
 
322 aa  298  7e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0307569  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4605  ATPase  50.48 
 
 
323 aa  298  7e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 
325 aa  297  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.33 
 
 
302 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0049  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.51 
 
 
319 aa  296  3e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  43.32 
 
 
340 aa  296  5e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  47.74 
 
 
310 aa  295  6e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2197  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53 
 
 
318 aa  295  7e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451133  decreased coverage  0.00303676 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2537  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.51 
 
 
320 aa  295  7e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  45.18 
 
 
308 aa  295  8e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1288  ATPase  50 
 
 
323 aa  295  9e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.73 
 
 
325 aa  294  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  49.2 
 
 
319 aa  293  2e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2205  hypothetical protein  49.03 
 
 
320 aa  293  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277828  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2110  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.79 
 
 
400 aa  292  5e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.625563  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1332  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.67 
 
 
323 aa  292  8e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  48.65 
 
 
319 aa  291  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1974  hypothetical protein  49.03 
 
 
296 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2122  hypothetical protein  49.03 
 
 
296 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 
306 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.11 
 
 
316 aa  289  5.0000000000000004e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  50 
 
 
302 aa  289  6e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.28 
 
 
310 aa  288  9e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3184  ATPase  50.33 
 
 
318 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  51.33 
 
 
306 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>