More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5730 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5730  quinolinate synthetase  100 
 
 
339 aa  695    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10830  quinolinate synthetase  84.31 
 
 
335 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324254  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3068  quinolinate synthetase  77.11 
 
 
337 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.736779  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3085  quinolinate synthetase  77.11 
 
 
337 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3128  quinolinate synthetase  77.11 
 
 
337 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3619  quinolinate synthetase  75.54 
 
 
347 aa  513  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170829  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2798  quinolinate synthetase  75.23 
 
 
347 aa  509  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11610  quinolinate synthetase  75.38 
 
 
349 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.681965  normal  0.363525 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2010  quinolinate synthetase complex, A subunit  73.65 
 
 
349 aa  502  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.701511  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2965  quinolinate synthetase complex, A subunit  75.08 
 
 
348 aa  499  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0394  quinolinate synthetase complex, A subunit  70.44 
 
 
332 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3166  quinolinate synthetase  73.29 
 
 
334 aa  461  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000173598  hitchhiker  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0575  quinolinate synthetase  67.3 
 
 
332 aa  449  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120653  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3459  quinolinate synthetase complex, A subunit  68.77 
 
 
462 aa  424  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  65.93 
 
 
326 aa  427  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4593  quinolinate synthetase complex, A subunit  60.26 
 
 
346 aa  361  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0283  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1239  quinolinate synthetase complex subunit A  52.75 
 
 
318 aa  356  1.9999999999999998e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2476  quinolinate synthetase complex, A subunit  58.77 
 
 
320 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.29 
 
 
323 aa  324  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000830693  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0960  quinolinate synthetase complex, A subunit  54.05 
 
 
336 aa  316  4e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.257162  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  51.1 
 
 
331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0531  quinolinate synthetase  46.15 
 
 
308 aa  295  9e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.119326  normal  0.153731 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  48.69 
 
 
302 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1578  quinolinate synthetase  46.3 
 
 
308 aa  272  5.000000000000001e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  48.04 
 
 
302 aa  272  7e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  45.98 
 
 
303 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  47.92 
 
 
302 aa  269  4e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.81 
 
 
332 aa  258  7e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  42.49 
 
 
304 aa  258  9e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.77 
 
 
301 aa  256  4e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  46.13 
 
 
310 aa  255  7e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.66 
 
 
298 aa  255  8e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  42.77 
 
 
304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  41.85 
 
 
304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  43.32 
 
 
307 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  42.63 
 
 
304 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.48 
 
 
324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  42.43 
 
 
304 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  41.23 
 
 
322 aa  250  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.91 
 
 
303 aa  250  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.8 
 
 
331 aa  250  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.06 
 
 
317 aa  249  5e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.25 
 
 
303 aa  249  6e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  44.86 
 
 
334 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  43.44 
 
 
322 aa  247  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  44.69 
 
 
334 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.09 
 
 
308 aa  246  4e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  44.48 
 
 
304 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.37 
 
 
306 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  42.27 
 
 
333 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  41.72 
 
 
328 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07931  quinolinate synthetase  40.76 
 
 
312 aa  242  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907888 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07381  quinolinate synthetase  41.72 
 
 
328 aa  242  5e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  43.73 
 
 
306 aa  242  6e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  41.27 
 
 
311 aa  242  7e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  43.73 
 
 
334 aa  242  9e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.19 
 
 
334 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.72 
 
 
304 aa  241  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  41.07 
 
 
323 aa  241  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.86 
 
 
330 aa  240  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  43.41 
 
 
334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.24 
 
 
338 aa  239  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0382  quinolinate synthetase  38.91 
 
 
301 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  41.46 
 
 
325 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  41.46 
 
 
325 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.52 
 
 
302 aa  238  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0614  quinolinate synthetase  42.72 
 
 
306 aa  237  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.853545  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4055  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.63 
 
 
310 aa  237  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0868  quinolinate synthetase  40.25 
 
 
324 aa  236  4e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0535  quinolinate synthetase  39.94 
 
 
318 aa  236  6e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2150  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.77 
 
 
311 aa  235  8e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.484842  normal  0.0905755 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4715  quinolinate synthetase  41.49 
 
 
348 aa  235  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0705171  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0699  quinolinate synthetase  42.2 
 
 
359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0575  quinolinate synthetase  40.13 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.426924 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  42.39 
 
 
310 aa  233  3e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0376  quinolinate synthetase  37.94 
 
 
301 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  41.1 
 
 
323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5129  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.81 
 
 
329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  42.53 
 
 
304 aa  232  5e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  42.95 
 
 
306 aa  232  6e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.56 
 
 
307 aa  232  6e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1448  quinolinate synthetase  40.88 
 
 
320 aa  232  7.000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  42.63 
 
 
304 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  40.91 
 
 
324 aa  230  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5463  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.75 
 
 
338 aa  229  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222387  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1107  quinolinate synthetase  42.69 
 
 
370 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  41.67 
 
 
304 aa  229  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1229  quinolinate synthetase  42.94 
 
 
370 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  37.22 
 
 
303 aa  228  8e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  39.49 
 
 
308 aa  228  1e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2907  quinolinate synthetase complex subunit A  39.94 
 
 
320 aa  228  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0438  quinolinate synthetase  44.17 
 
 
343 aa  227  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  41.1 
 
 
304 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  40.91 
 
 
304 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1434  quinolinate synthetase  42.61 
 
 
343 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582213  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2870  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.08 
 
 
357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1004  quinolinate synthetase  43.56 
 
 
343 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529282  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1429  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.86 
 
 
328 aa  226  6e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.08 
 
 
347 aa  225  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4975  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.58 
 
 
322 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>